CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = M84V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp384M84VM902VnonsynAtgGtg276827620.9978322969-2971
ORF1ab/nsp384M84VM902VnonsynAtGGtA276840.001445092969-2971
ORF1ab/nsp384M84VM902VnonsynAtGGtT276820.0007225432969-2971

Details of the mutation M84V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg27622768All0.000528
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtA42768All0.000001
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtT22768All0
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg588588B.1.1.5230.91875
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg487487AY.50.010056
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg265265AY.240.114224
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg171171B.1.5900.777273
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg138139B.1.1.70.000124
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtA1139B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg108108AY.440.000657
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg7979B.1.360.011526
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg7373AY.60.003002
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg6868B.10.000623
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg6868B.1.617.20.000256
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg5353AY.430.000235
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg4747AY.40.000073
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg4141B.1.2430.002853
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg4141P.10.000646
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg3636AY.1030.000224
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg3636B.1.10.000653
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg3131AY.34.10.015808
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg3030B.1.1.3540.131579
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg2828AY.30.000278
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg2828B.1.1770.000369
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg2727AY.110.036145
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg1921B.1.20.000167
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtA121B.1.20.000009
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtT121B.1.20.000009
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg2020AY.250.00012
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg1414AY.1200.000521
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg1212C.370.001393
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg1111AY.1020.000292
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg1010AY.1000.00046
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg99AY.1100.001014
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg99AY.120.10.002889
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg99B.1.5600.041667
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg77AY.390.000173
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg77AY.740.00081
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg77AY.9.10.000586
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg66B.1.1.3110.002149
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg66B.1.6230.003219
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg55AY.1060.001674
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg55AY.5.40.001384
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg55B.1.1.10.001633
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg55B.1.1310.04386
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg55C.160.005302
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg44AY.230.000279
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg44B.1.1080.023256
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg44R.10.00036
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.1140.000693
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.16.10.00141
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg23AY.260.000057
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtT13AY.260.000028
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.470.000093
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.610.000314
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.750.000168
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.860.00249
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33B.1.1.2160.002671
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33B.1.2980.006342
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22A.30.004193
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.200.000078
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.330.000134
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.540.000191
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.620.000871
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AY.920.000575
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22AZ.10.001735
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.177.80.001505
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.258.30.00335
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.438.10.000215
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg22C.37.10.005236
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11A.20.000662
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AE.80.000489
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.130.000161
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.140.000088
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.290.000016
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.410.000294
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.460.000104
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.670.000464
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtA11AY.790.001211
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.840.000437
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.850.000427
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.930.000273
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.970.001701
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.980.000079
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B0.000128
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1.480.002874
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp384M84VAtGGtA11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.177.880.012346
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1890.004292
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.1990.004132
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp384M84VAtgGtg11Q.80.000165