CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = M196T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3196M196TM1014TnonsynaTgaCg5004980.9963305-3307
ORF1ab/nsp3196M196TM1014TnonsynaTGaCT50020.0043305-3307

Details of the mutation M196T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg498500All0.000095
ORF1ab/nsp3196M196TaTGaCT2500All0
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg6061B.1.1.70.000054
ORF1ab/nsp3196M196TaTGaCT161B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg5353B.1.5260.001246
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg4444AY.1030.000273
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg4343AY.40.000067
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg4242AY.310.777778
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg4141AY.230.00286
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg3535AY.4.20.000759
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg2323B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg1616B.1.20.000141
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg1515B.10.000137
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg99B.1.1.630.003472
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg88B.1.177.600.001747
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg77AY.1020.000186
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg77AY.30.00007
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg77AY.430.000031
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg66AY.200.000233
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg55AY.610.000524
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg55B.1.3510.000149
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg55B.1.5250.000566
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg44B.1.1.2860.011594
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg33AY.250.000018
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg33AY.440.000018
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg120.055556
ORF1ab/nsp3196M196TaTGaCT120.055556
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22AY.390.000049
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22AY.450.000243
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22AY.80.001212
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22AY.980.000158
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.130.000161
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.470.000031
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.490.003195
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.570.000656
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.650.000533
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.880.000884
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.90.000068
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.1.440.00241
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11P.20.000187
ORF1ab/nsp3196M196TaTgaCg11Q.80.000165