CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = M1788V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31788M1788VM2606VnonsynAtgGtg3102880.9290328081-8083
ORF1ab/nsp31788M1788VM2606VnonsynAtGGtA310210.06774198081-8083
ORF1ab/nsp31788M1788VM2606VnonsynAtGGtT31010.003225818081-8083

Details of the mutation M1788V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg288310All0.000055
ORF1ab/nsp31788M1788VAtGGtA21310All0.000004
ORF1ab/nsp31788M1788VAtGGtT1310All0
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg7575AA.70.688073
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg3434B.1.5260.000799
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg2929AY.30.000288
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg2828AY.40.000044
ORF1ab/nsp31788M1788VAtGGtA2123B.1.20.000185
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg223B.1.20.000018
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg1616B.1.1.3110.005731
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg1515B.1.438.10.001609
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg99B.1.1.70.000008
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg88AY.50.000165
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg77AY.750.000392
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg66B.1.1.2140.000333
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg55B0.000639
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg44P.1.10.001271
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg22AY.610.00021
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg22P.10.000032
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11A.10.000282
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.450.000122
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.570.000656
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.177.500.004695
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31788M1788VAtGGtT11C.350.000774
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11C.360.000911
ORF1ab/nsp31788M1788VAtgGtg11Q.80.000165