CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = M1547I

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31547M1547IM2365InonsynatGatT393836460.9258517358-7360
ORF1ab/nsp31547M1547IM2365InonsynatGatA39382590.06576947358-7360
ORF1ab/nsp31547M1547IM2365InonsynatGatC3938330.008379897358-7360

Details of the mutation M1547I within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT36463938All0.000697
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA2593938All0.00005
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC333938All0.000006
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT888898B.1.1.70.000795
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA6898B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC4898B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT753765AY.40.001172
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11765AY.40.000017
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC1765AY.40.000002
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT193193B.1.4480.506562
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT173175AY.430.000766
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA1175AY.430.000004
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC1175AY.430.000004
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT135136B.1.5960.011764
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA1136B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA118119B.1.4270.005959
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1119B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT109115B.1.617.20.00041
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA6115B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT9494B.1.5770.064605
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT7987AY.440.000481
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA887AY.440.000049
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT6969AY.200.002682
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT5662B.1.3510.001665
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA362B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC362B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT4358AY.250.000259
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA1358AY.250.000078
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC258AY.250.000012
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT5858B.1.5250.006563
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT5454AY.1190.001907
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT4646AY.99.20.004239
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT3839P.10.000599
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA139P.10.000016
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT3838B.1.177.860.006971
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT3738B.1.617.10.004772
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA138B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT3434B.1.5700.1
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2432AY.1030.000149
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC632AY.1030.000037
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA232AY.1030.000012
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT3232AY.4.10.023599
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2431B.10.00022
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA531B.10.000046
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC231B.10.000018
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2531B.1.10.000454
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA531B.1.10.000091
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC131B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2727AY.50.000558
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2626AY.4.40.010638
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2222AY.1020.000583
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT2222AY.390.000544
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1920B.1.20.000167
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC120B.1.20.000009
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1619AY.30.000159
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA319AY.30.00003
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1919B.1.1.5190.000755
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1317P.1.140.000621
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA417P.1.140.000191
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA1016AY.330.000668
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT616AY.330.000401
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1616B.1.1.3480.012739
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA1515B.1.1.2200.027881
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1415B.1.5260.000329
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA115B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1314AY.420.000523
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC114AY.420.00004
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1414AY.610.001467
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1414B.1.2790.007191
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA913AY.360.001334
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT313AY.360.000445
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC113AY.360.000148
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1212AY.640.007143
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT1011AY.4.20.000217
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA111AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT711B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA411B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT911B.1.2210.000639
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA211B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT810B.1.1600.00025
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA110B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC110B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT99AY.1210.001218
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT99AY.260.000255
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT99AY.620.003922
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT99AY.940.003984
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT99B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT88AY.290.000126
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT88B.1.177.210.000612
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA88C.370.000929
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT88P.1.150.001859
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT57AY.230.000349
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC27AY.230.000139
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT77B.1.4290.000165
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT56AY.1200.000186
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA16AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT56AY.300.001979
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC16AY.300.000396
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT66AY.450.00073
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT66AY.7.10.000676
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT66B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT66Q.80.000989
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55AY.1160.001434
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55AY.140.00044
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55AY.470.000156
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55AY.980.000395
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT45B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA15B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT55B.1.3690.001426
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44AY.120.001264
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44AY.510.003636
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44AY.740.000463
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44AY.750.000224
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT24AY.910.001461
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC24AY.910.001461
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT24AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA24AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44B.1.1.3330.004306
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44B.1.177.600.000874
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44B.1.258.170.000416
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44B.1.5750.001214
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT24B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA24B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT44D.50.0199
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33AY.1100.000338
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT23AY.460.000208
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA13AY.460.000104
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA23AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT13AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33B.1.1.2140.000166
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33B.1.1.2910.002227
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33B.1.1.3740.007126
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33B.1.360.000438
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT33B.1.36.370.008333
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT23D.20.00015
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC13D.20.000075
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AD.20.000438
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.370.000632
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA12AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT12AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.540.000191
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.650.001066
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC12AY.670.000464
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA12AY.670.000464
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.700.000417
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.1.1630.015267
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.1.510.003436
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC12B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT12B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA22B.1.3360.004878
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.4080.00738
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.4090.001563
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.4560.006536
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22B.1.5740.004301
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT22Q.70.002222
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT110.055556
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AE.80.000489
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatC11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.270.000065
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.480.000465
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.570.000656
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.760.004831
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.790.001211
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11AY.850.000427
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.970.001701
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11AZ.30.00152
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.1580.012195
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.3770.001381
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.470.005348
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.120.008
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.177.800.001912
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.258.110.000396
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.258.140.00098
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.2700.005618
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.36.360.000602
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.4740.001901
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.1.6310.003367
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11B.1.6320.006711
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatA11B.1.940.027027
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11B.390.002331
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11C.180.002591
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11C.350.000774
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11C.360.000911
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11Q.20.000613
ORF1ab/nsp31547M1547IatGatT11R.10.00009