CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = M1441T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31441M1441TM2259TnonsynaTgaCg3042940.9671057040-7042
ORF1ab/nsp31441M1441TM2259TnonsynaTGaCT304100.03289477040-7042

Details of the mutation M1441T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg294304All0.000056
ORF1ab/nsp31441M1441TaTGaCT10304All0.000002
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg8989AY.540.008486
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg2626B.1.4290.000612
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg1624B.1.1.70.000014
ORF1ab/nsp31441M1441TaTGaCT824B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg2323AY.40.000036
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg1818B.1.5260.000423
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg1515B.1.617.20.000056
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg1111P.10.000173
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg1010AY.260.000283
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg99B.1.4090.007031
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg88AY.440.000049
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg55B.1.2210.000355
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg44AY.940.001771
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg44B.10.000037
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg33AY.200.000117
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg33AY.290.000047
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg33AY.390.000074
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg33AY.430.000013
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg33AY.680.000821
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg22AY.250.000012
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg22B.1.1.5180.012658
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg22B.1.5380.016129
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp31441M1441TaTGaCT11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11AY.670.000464
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11AY.920.000287
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp31441M1441TaTGaCT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.1.3220.008772
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.6020.006536
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11B.6.80.008264
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp31441M1441TaTgaCg11P.20.000187