CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = M1441L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31441M1441LM2259LnonsynAtgTtg1921490.7760427040-7042
ORF1ab/nsp31441M1441LM2259LnonsynAtgCtg192410.2135427040-7042
ORF1ab/nsp31441M1441LM2259LnonsynAtGCtT19210.005208337040-7042
ORF1ab/nsp31441M1441LM2259LnonsynAtGCtA19210.005208337040-7042

Details of the mutation M1441L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg149192All0.000028
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg41192All0.000008
ORF1ab/nsp31441M1441LAtGCtA1192All0
ORF1ab/nsp31441M1441LAtGCtT1192All0
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg6464B.1.177.600.01398
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg2425B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg125B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg1414AY.1180.000877
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg1111B.1.2430.000765
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg89B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg19B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg77AY.1030.000043
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg55AY.40.000008
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg35B.10.000027
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg25B.10.000018
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg44AY.470.000124
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg33B.1.1.2040.009119
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg23B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg13B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg22A.2.40.006734
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg22AY.290.000032
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg12B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg12B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11AY.340.000097
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg11AY.430.000004
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11AY.980.000079
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp31441M1441LAtGCtT11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg11B.1.1.4660.008696
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11B.1.5730.006098
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11B.1.6390.021739
ORF1ab/nsp31441M1441LAtGCtA11C.350.000774
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgCtg11D.20.000075
ORF1ab/nsp31441M1441LAtgTtg11P.20.000187