CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = L923L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3923L923LL1741LsynttAttG331832790.9882465486-5488
ORF1ab/nsp3923L923LL1741LsynTtaCta3318390.01175415486-5488

Details of the mutation L923L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG32793318All0.000627
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta393318All0.000007
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG19261926A.2.50.961078
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG619619A.2.5.20.97327
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG208208A.2.5.11
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG8787A.2.5.30.896907
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG6667AY.250.000397
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta167AY.250.000006
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG4040B.1.4270.00202
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG3535B.1.2430.002435
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG3232AY.440.000195
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG2929AY.470.000902
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG2228B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta628B.1.1.70.000005
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG2626AY.40.00004
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG2424B.1.3510.000713
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG1821B.1.20.000158
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta321B.1.20.000026
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG1414AY.200.000544
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG1314B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta114B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG1313AY.1180.000814
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG1313C.370.001509
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta611B.1.10.000109
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG511B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG88AY.50.000165
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG56B.1.4290.000118
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta16B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG55A.20.003309
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG45B.10.000037
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta15B.10.000009
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG44P.10.000063
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta33AY.330.0002
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22A0.000774
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG12AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta12AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22AY.420.00008
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG12AY.430.000004
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta12AY.430.000004
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22AY.610.00021
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG12B0.000128
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta12B0.000128
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta22B.1.1.1340.022727
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22B.1.1.2650.006309
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22B.1.1570.00597
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11A.10.000282
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.390.000025
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.460.000104
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11AY.690.000187
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.1.4070.041667
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.3380.008621
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11B.1.5810.009434
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11B.520.010101
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp3923L923LTtaCta11P.1.50.076923
ORF1ab/nsp3923L923LttAttG11P.1.70.000319