CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = L862L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3862L862LL1680LsynttGttA283626320.9280685303-5305
ORF1ab/nsp3862L862LL1680LsynTtgCtg28362040.07193235303-5305

Details of the mutation L862L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA26322836All0.000503
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg2042836All0.000039
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA935944AY.250.005624
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg9944AY.250.000054
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA271271B.1.1.440.653012
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA216249B.1.1.70.000193
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg33249B.1.1.70.00003
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA187192B.1.617.20.000704
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg5192B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA110137AY.430.000487
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg27137AY.430.00012
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA106110AY.440.000645
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg4110AY.440.000024
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg8086AY.470.002488
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA686AY.470.000187
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA5256B.10.000476
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg456B.10.000037
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA5056B.1.20.00044
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg656B.1.20.000053
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA4449AY.40.000068
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg549AY.40.000008
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA3838B.1.6370.002777
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA3536AY.1030.000217
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg136AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA2626AY.9.20.000955
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA2424B.1.5260.000564
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA2323AY.1020.00061
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA2323B.1.1.4340.008017
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA2323Q.10.002906
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA2121B.1.2210.001492
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA1718B.1.10.000308
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg118B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA1616AY.260.000453
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA1414AY.330.000935
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg1013B.1.4290.000235
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA313B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA1212B.1.2400.002587
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99AY.30.00009
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA89AY.390.000198
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg19AY.390.000025
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99AY.4.20.000195
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99AY.5.40.00249
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99AY.90.000608
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99AY.98.10.000436
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99B.1.1.2540.101124
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99B.1.5750.002731
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA99P.10.000142
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA88AY.120.10.002568
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA88B.1.4090.00625
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA77AY.160.002658
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA77AY.880.006189
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA77B.1.1.3170.002882
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA77B.1.1600.000218
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA77B.1.6210.00062
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA66AY.1200.000223
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA66AY.420.000241
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA56B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg16B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA56B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg16B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA66B.1.2430.000418
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA66B.1.5170.002562
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA66B.1.5670.02
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA66B.1.5820.002944
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA55AY.1180.000313
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA55AY.200.000194
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA55AY.460.00052
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA55AY.930.001365
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA440.222222
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA44A.270.006623
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA44AY.46.40.000658
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA44AY.46.60.000289
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg34AY.50.000062
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA14AY.50.000021
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA44B.1.1.4200.004024
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA44B.1.1.4860.006309
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA44B.1.1810.078431
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33AY.290.000047
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33AY.4.40.001227
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33AY.540.000286
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA23AY.610.00021
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg13AY.610.000105
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33AY.700.000626
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33AY.730.001996
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg23AY.750.000112
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA13AY.750.000056
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA23AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg13AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33B.1.36.290.001552
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33C.370.000348
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA33P.1.160.001122
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg12AY.1160.000287
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA12AY.1160.000287
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.140.000176
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.240.000862
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.450.000243
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.490.00639
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.60.000082
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.660.002139
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.670.000929
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.860.00166
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.1.1610.007067
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.1.3620.011236
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.177.770.001452
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.3490.00143
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.4430.009346
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.4780.023529
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.5430.02
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.5600.009259
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.5880.00182
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22P.1.170.000324
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22Q.30.00029
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA22Q.80.00033
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.10.000396
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.20.000356
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.300.000396
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.340.000097
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.350.000233
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.370.000316
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.380.000499
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg11AY.410.000294
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.5.20.002463
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.520.000814
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.580.000907
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.620.000436
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.640.000595
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.650.000533
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.70.000196
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.710.000475
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.720.001361
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.740.000116
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B0.000128
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.5180.006329
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.1.740.00431
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.2540.025
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3050.002151
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3060.005714
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3130.006579
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3550.011111
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.3970.004854
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.4050.012346
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.595.10.005848
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp3862L862LTtgCtg11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11P.60.003145
ORF1ab/nsp3862L862LttGttA11P.70.004367