CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = L623L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3623L623LL1441LsynCtaTta650364290.9886214586-4588
ORF1ab/nsp3623L623LL1441LsynctActG6503600.009226514586-4588
ORF1ab/nsp3623L623LL1441LsynctActT650390.001383984586-4588
ORF1ab/nsp3623L623LL1441LsynctActC650350.0007688764586-4588

Details of the mutation L623L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta64296503All0.00123
ORF1ab/nsp3623L623LctActG606503All0.000011
ORF1ab/nsp3623L623LctActT96503All0.000002
ORF1ab/nsp3623L623LctActC56503All0.000001
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11351139B.1.1.70.001016
ORF1ab/nsp3623L623LctActG21139B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3623L623LctActT11139B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3623L623LctActC11139B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta644649AY.40.001002
ORF1ab/nsp3623L623LctActG3649AY.40.000005
ORF1ab/nsp3623L623LctActC2649AY.40.000003
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta340340AY.39.10.013469
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta331331AY.440.002015
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta305310B.1.617.20.001148
ORF1ab/nsp3623L623LctActG5310B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta204205AY.250.001227
ORF1ab/nsp3623L623LctActG1205AY.250.000006
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta193195B.1.20.001699
ORF1ab/nsp3623L623LctActG2195B.1.20.000018
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta168168AY.740.019429
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta151154B.10.001383
ORF1ab/nsp3623L623LctActT2154B.10.000018
ORF1ab/nsp3623L623LctActG1154B.10.000009
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta152152AY.470.004728
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta142142AY.30.001412
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta123133AY.430.000545
ORF1ab/nsp3623L623LctActG10133AY.430.000044
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta100106P.10.001575
ORF1ab/nsp3623L623LctActG6106P.10.000095
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta7883B.1.10.001415
ORF1ab/nsp3623L623LctActT583B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta7982AY.1030.000491
ORF1ab/nsp3623L623LctActG382AY.1030.000019
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta8282B.1.1770.00108
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta7474AY.1020.001962
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta7171AY.860.058921
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta6565B.1.2580.004326
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta6263AY.50.00128
ORF1ab/nsp3623L623LctActG163AY.50.000021
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta6262B.1.160.270.939394
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta5959B.1.1.4200.059356
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta5151B.1.4270.002575
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta5050B.1.5260.001175
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta4549AY.390.001112
ORF1ab/nsp3623L623LctActG449AY.390.000099
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta4949B.1.1600.001528
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta4848AY.98.10.002325
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta4141AY.46.60.002961
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta3939B.1.258.170.004055
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta3939B.1.3510.001159
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta3838AY.1110.00696
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta3535AY.260.000991
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta3030B.1.1390.021994
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2929B.1.177.560.019359
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2828B.1.1.720.848485
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2828B.1.2430.001948
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2727AY.290.000426
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2327AY.750.001289
ORF1ab/nsp3623L623LctActG427AY.750.000224
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2626B.1.6210.002301
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2525B.1.6370.001827
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2324B.1.1.280.007158
ORF1ab/nsp3623L623LctActC124B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2424B.1.177.210.001835
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2323B.1.617.10.002966
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2222AY.4.20.000477
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2121AY.540.002002
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2121B.1.177.810.003976
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2121B.1.177.860.003853
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2020B.1.1.5190.000794
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta2020B.1.4290.000471
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1919B.1.4990.019958
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1919Q.10.0024
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1717AY.1000.000782
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1617B.1.5820.007851
ORF1ab/nsp3623L623LctActT117B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1616C.370.001857
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1515B.1.1900.15
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1515B.1.2340.001979
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1314AY.1190.000459
ORF1ab/nsp3623L623LctActG114AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1414AY.99.20.00129
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1414B.1.177.40.002955
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1414B.1.3050.030108
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1414B.1.5880.012739
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1313AY.60.000535
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1313AY.930.00355
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1313B.1.2210.000923
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1313B.1.4690.046931
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1212AY.4.40.00491
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1212B.1.5960.001046
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010AY.1210.001353
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010AY.420.000402
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010AY.90.000676
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010B.1.1.100.011148
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010B.1.1.2140.000555
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010B.1.1.3180.003018
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010B.1.1.330.004209
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010B.1.3670.007924
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010B.6.60.008889
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010C.36.30.005672
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta1010P.1.150.002323
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta99AY.1070.004194
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta99AY.300.003562
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta99P.1.170.001456
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88AD.20.001752
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88AY.330.000534
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88AY.340.000776
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88AY.4.30.006734
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88B.1.1.1980.011747
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88B.1.1.4340.002788
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88B.1.2220.013536
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88B.1.360.001167
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta88P.1.140.000382
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta77AY.120.002212
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta77AY.120.10.002247
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta77B.1.1.700.002387
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta77B.1.110.30.005029
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta77B.1.36.290.003621
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta77B.1.36.80.007
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66AY.610.000629
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66AY.680.001642
ORF1ab/nsp3623L623LctActG66AY.70.001176
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66AY.950.004566
ORF1ab/nsp3623L623LctActG66AY.960.012448
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66B.1.1.3720.004132
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66B.1.36.10.006842
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66B.1.4710.016393
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66B.1.5250.000679
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66B.1.5950.001566
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66B.1.6280.002114
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta66Q.40.002729
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta45AY.1090.002959
ORF1ab/nsp3623L623LctActC15AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55AY.20.001781
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55AY.270.000324
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55AY.350.001165
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55AY.880.004421
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55B.1.1.10.001633
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55B.1.1.2160.004452
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55B.1.1.3060.002192
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta55B.1.466.20.001956
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.1140.000924
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.1160.001147
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.130.000644
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.360.000593
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.450.000487
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44AY.980.000316
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B0.000511
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.1.2550.012121
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.1.3730.095238
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.177.160.002658
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.2060.003263
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.3110.001098
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.5640.001704
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44B.1.6090.001918
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44C.160.004242
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta44Q.80.00066
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33A.23.10.002113
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.1180.000188
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.240.001293
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.3.10.000256
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.320.001597
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.460.000312
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.570.001969
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33AY.590.001589
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.1.1920.006928
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.1.2840.000322
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.1.2850.019608
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.1.3740.007126
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.214.20.001799
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.2400.000647
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.2650.003812
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.3960.002117
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.4970.000944
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33B.400.001093
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33C.1.20.012766
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33C.360.002732
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta33D.20.000225
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22A0.000774
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22A.30.004193
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.10.000791
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.1100.000225
ORF1ab/nsp3623L623LctActG12AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta12AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.140.000176
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.230.000139
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.280.003781
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.500.001599
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.510.001818
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.620.000871
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.650.001066
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.660.002139
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.760.009662
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.910.001461
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22AY.920.000575
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.1.1410.004024
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.1.2070.002364
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.1.310.133333
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.177.120.000303
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.177.50.002484
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.177.70.00033
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.177.800.003824
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.2350.005038
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.2450.0625
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.36.180.00084
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.3770.009132
ORF1ab/nsp3623L623LctActG12B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta12B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.4950.018182
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.5400.019417
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.230.005848
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22B.40.004415
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22C.110.021277
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22P.20.000373
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22P.30.00319
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta22P.40.007605
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AU.10.001266
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.100.00053
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.160.00038
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.190.00114
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.480.000465
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.520.000814
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.690.000187
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp3623L623LctActG11AY.710.000475
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11AY.770.001127
ORF1ab/nsp3623L623LctActG11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.1130.006993
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.2430.004082
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.2510.007937
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.2960.018182
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp3623L623LctActG11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.4120.007634
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1170.0125
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1190.010526
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.160.120.00641
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.2740.011905
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.2770.02381
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3250.006897
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.362.20.004717
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.390.003906
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.4380.006536
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.5610.000397
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.5680.001111
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.6020.006536
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.617.30.002985
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.6250.002353
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.1.910.002075
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.270.015385
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.30.000831
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11B.60.00091
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11C.120.007194
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11C.30.007634
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11C.350.000774
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11R.10.00009
ORF1ab/nsp3623L623LCtaTta11W.10.008696