CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = L287L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3287L287LL1105LsynttAttG3952490.630383578-3580
ORF1ab/nsp3287L287LL1105LsynTtaCta3951440.3645573578-3580
ORF1ab/nsp3287L287LL1105LsynTtACtT39510.002531653578-3580
ORF1ab/nsp3287L287LL1105LsynTtACtC39510.002531653578-3580

Details of the mutation L287L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG249395All0.000048
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta144395All0.000028
ORF1ab/nsp3287L287LTtACtT1395All0
ORF1ab/nsp3287L287LTtACtC1395All0
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG9292B.1.5710.893204
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta4447AY.1030.000273
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG347AY.1030.000019
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG4146B.10.000376
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta546B.10.000046
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG2231B.1.1.70.00002
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta931B.1.1.70.000008
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta3030AY.470.000933
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG1720AY.40.000026
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta320AY.40.000005
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta1213B.1.2430.000835
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG113B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG911B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta211B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG910P.10.000142
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta110P.10.000016
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta77B.1.2400.001509
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta35AY.1020.00008
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG25AY.1020.000053
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG55AY.430.000022
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta24AY.420.00008
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG24AY.420.00008
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta34AY.440.000018
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG14AY.440.000006
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG44B.1.177.60.003906
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta44C.370.000464
ORF1ab/nsp3287L287LTtACtC13AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta13AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG13AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG33AY.99.20.000276
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG33B.1.4270.000151
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG22AY.290.000032
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta12AY.390.000025
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG12AY.390.000025
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta22AY.610.00021
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG22AY.860.00166
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG22B.1.1.370.000386
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta22B.1.3990.003868
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG22B.1.4160.002538
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG12B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3287L287LTtACtT12B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta22P.1.140.000096
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.160.00038
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11AY.940.000443
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.1.3330.001076
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp3287L287LttAttG11B.1.5580.004566
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11B.4.10.018868
ORF1ab/nsp3287L287LTtaCta11P.1.160.000374