CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = L1417del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31417L1417delL2235deldelCTA---18818816968-6970

Details of the mutation L1417del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---188188All0.000036
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---6767B.1.1.70.00006
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---1515AY.40.000023
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---1414B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---1212B.10.00011
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---77B.1.10.000127
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---660.333333
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---33AY.430.000013
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---33B.1.2210.000213
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---22P.10.000032
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---22U.30.007722
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11A.280.002646
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.240.000431
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.730.000665
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.160.230.004831
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.680.015152
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.258.100.011364
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp31417L1417delCTA---11P.1.150.000232