CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = L1357L

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31357L1357LL2175LsynttAttG323232120.9938126788-6790
ORF1ab/nsp31357L1357LL2175LsynTtaCta3232200.006188126788-6790

Details of the mutation L1357L within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG32123232All0.000614
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta203232All0.000004
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG13531359AY.40.002106
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta61359AY.40.000009
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG537540B.1.1.70.000481
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta3540B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG521521B.1.177.800.996176
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG270270B.1.1770.003555
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG8888B.1.5260.002068
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG6971B.1.617.20.00026
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta271B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG3131AY.1020.000822
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG2929AY.390.000717
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG2828AY.430.000124
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG2727B.1.20.000238
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG2727C.370.003134
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG2323AY.300.009102
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG1515AY.360.002223
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG1314AY.30.000129
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta114AY.30.00001
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG1111P.1.140.000526
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG99B.10.000082
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG88A.10.002255
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG77A.20.004633
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG77A.2.50.003493
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG77B.1.4290.000165
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG77P.10.00011
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG66AY.440.000037
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta55AD.20.001095
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG55AY.250.00003
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG55AY.260.000142
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG45B.1.10.000073
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta15B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG55B.1.214.20.002998
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG44AY.200.000155
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG44B.1.1.5190.000159
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG33AY.1180.000188
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG33B.1.2180.015464
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG33B.1.5540.013216
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG33Q.40.001364
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22AU.30.004219
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta12AY.1170.000085
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG12AY.1170.000085
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.1.250.001137
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.1.3040.005618
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.1.3170.000823
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.1470.001512
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.177.150.001262
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG12B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31357L1357LTtaCta12B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11A.210.00277
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.420.00004
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.470.000031
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.540.000095
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.790.001211
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.980.000079
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.1590.004673
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.177.330.001645
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11N.60.007092
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31357L1357LttAttG11Q.70.001111