CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = I441V

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3441I441VI1259VnonsynAttGtt312031190.999684040-4042
ORF1ab/nsp3441I441VI1259VnonsynAtTGtC312010.0003205134040-4042

Details of the mutation I441V within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt31193120All0.000597
ORF1ab/nsp3441I441VAtTGtC13120All0
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt18451845B.1.2210.131056
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt488488P.10.007688
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt207207P.1.80.990431
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt200200P.1.90.961538
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt103103B.1.1.70.000092
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt4141AY.39.10.001624
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt4040B.1.360.005836
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt2323B.1.617.20.000087
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt1717AY.40.000026
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt1616AY.1030.000099
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt1414B.1.20.000123
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt99AY.250.000054
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt99B.1.1600.000281
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt88AY.440.000049
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt77B.1.177.430.01034
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt66AY.200.000233
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt66C.36.30.003403
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt55B.10.000046
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt55B.1.36.180.002101
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt44AY.290.000063
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt44AY.4.50.00043
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt44B.1.5240.005626
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt33B.1.177.120.000455
ORF1ab/nsp3441I441VAtTGtC120.055556
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt120.055556
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22AY.330.000134
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22AY.470.000062
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22B.1.177.70.00033
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22B.1.90.012346
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt22P.1.130.001797
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AD.20.000219
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AU.20.002421
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11AY.580.000907
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B0.000128
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.177.770.000726
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11B.1.5970.00463
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11P.70.004367
ORF1ab/nsp3441I441VAttGtt11Q.80.000165