CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = I385T

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3385I385TI1203TnonsynaTcaCc9679600.9927613872-3874
ORF1ab/nsp3385I385TI1203TnonsynaTCaCA96740.00413653872-3874
ORF1ab/nsp3385I385TI1203TnonsynaTCaCT96730.003102383872-3874

Details of the mutation I385T within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc960967All0.000184
ORF1ab/nsp3385I385TaTCaCA4967All0.000001
ORF1ab/nsp3385I385TaTCaCT3967All0.000001
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc329329B.1.1.2041
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc174174B.1.1.70.000156
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc8686AY.40.000134
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc6767B.1.617.20.000252
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc4949AY.430.000217
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc3434B.1.1.3720.023416
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc3030AY.460.003122
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc2222B.1.5260.000517
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc2020B.10.000183
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc1212AY.250.000072
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc1111B.60.010009
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc99B.1.20.000079
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc380.166667
ORF1ab/nsp3385I385TaTCaCT380.166667
ORF1ab/nsp3385I385TaTCaCA280.111111
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc66AY.390.000148
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc55AY.30.00005
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc55B.6.60.004444
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc44AY.360.000593
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc44AY.440.000024
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc44AY.650.002132
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc44B.1.2400.000862
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc44B.1.2810.086957
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc33AY.200.000117
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc33AY.930.000819
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc33P.10.000047
ORF1ab/nsp3385I385TaTCaCA12A.10.000282
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc12A.10.000282
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22AY.230.000139
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22B.1.4270.000101
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22D.20.00015
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22N.50.003534
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc22Q.30.00029
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.160.00038
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.290.000016
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.330.000067
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.550.000917
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B0.000128
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.1.1330.008475
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.130.002375
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.177.780.009709
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3385I385TaTCaCA11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.4430.004673
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.5070.011236
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.5160.001957
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11B.40.002208
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp3385I385TaTcaCc11Q.10.000126