CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = G1389C

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31389G1389CG2207CnonsynGgtTgt7607570.9960536884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389CG2207CnonsynGgTTgC76030.003947376884-6886

Details of the mutation G1389C within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt757760All0.000145
ORF1ab/nsp31389G1389CGgTTgC3760All0.000001
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt367367B.1.1.70.000329
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt103103C.380.830645
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt6666AY.40.000103
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt3939B.1.20.000343
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1616B.10.000147
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1414AY.250.000084
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1111B.1.360.001605
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1111P.10.000173
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt77AY.430.000031
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt57AY.590.002648
ORF1ab/nsp31389G1389CGgTTgC27AY.590.001059
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt56AY.440.00003
ORF1ab/nsp31389G1389CGgTTgC16AY.440.000006
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt66AY.470.000187
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt55AY.200.000194
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt55AY.260.000142
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt55AY.290.000079
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44B.1.1.1760.001757
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33B.1.3890.003006
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.1.2610.017241
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.1.2790.002242
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.4800.004975
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22P.20.000373
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.60.00091
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11P.30.001595
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11R.10.00009