CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = F1503del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31503F1503delF2321deldelTTT---898917226-7228

Details of the mutation F1503del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---8989All0.000017
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---2020B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---88B.10.000073
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---440.222222
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---44AY.430.000018
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---33B.1.1.2180.023077
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---33B.1.4110.011111
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---22B.1.177.620.002384
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---22P.10.000032
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.420.00004
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.660.00107
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.760.004831
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B0.000128
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.5330.009615
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31503F1503delTTT---11P.1.150.000232