CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = F1354del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31354F1354delF2172deldelTTC---17117116779-6781

Details of the mutation F1354del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---171171All0.000033
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---7474B.1.1.70.000066
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---1414B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---99AY.40.000014
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---66AY.430.000027
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---33B.10.000027
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---22B.1.177.160.001329
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---22B.1.177.180.00232
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---22B.1.177.560.001335
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.390.000025
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.520.000814
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.730.000665
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.3610.045455
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.4.40.018868
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11B.400.000364
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11P.10.000016
ORF1ab/nsp31354F1354delTTC---11Q.20.000613