CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = F1142del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31142F1142delF1960deldelTTC---464616143-6145

Details of the mutation F1142del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---4646All0.000009
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---1111B.1.1.70.00001
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---33AY.250.000018
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---22C.370.000232
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11A.280.002646
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.660.00107
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.840.000437
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.850.000427
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11B.150.017544
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11C.350.000774
ORF1ab/nsp31142F1142delTTC---11P.10.000016