CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = F1089del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31089F1089delF1907deldelTTC---12912915984-5986

Details of the mutation F1089del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---129129All0.000025
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---4747B.1.1.70.000042
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---77AY.250.000042
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---66AY.430.000027
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---33B.10.000027
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---220.111111
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---22AY.670.000929
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---22C.370.000232
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---22P.10.000032
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.290.000016
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.540.000095
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.660.00107
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.850.000427
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.177.320.00135
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11B.150.017544
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11C.360.000911
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp31089F1089delTTC---11Q.20.000613