CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = E815D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3815E815DE1633DnonsyngaGgaT31859318520.999785162-5164
ORF1ab/nsp3815E815DE1633DnonsyngaGgaC3185970.0002197185162-5164

Details of the mutation E815D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT3185231859All0.006092
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC731859All0.000001
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT3114131141AY.470.968646
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT327327B.1.617.20.001231
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT6365B.1.1.70.000056
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC265B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2425AY.40.000037
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC125AY.40.000002
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2525AY.610.002619
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2525B.1.1.2220.0051
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2424AY.430.000106
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2222AY.650.011727
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT1717AY.30.000169
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT1515AY.400.014465
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT1313AY.250.000078
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT99AY.9.10.000754
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT89B.10.000073
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC19B.10.000009
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT88AY.75.10.001442
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77AY.1090.005178
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77AY.120.20.008997
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77AY.540.000667
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77B0.000895
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77B.1.36.80.007
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55AY.260.000142
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55AY.300.001979
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55AY.620.002179
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.130.000644
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.440.000024
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT33AY.450.000365
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT33AY.750.000168
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.100.00106
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.230.000139
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.330.000134
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22B.1.1.3980.006452
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC11AY.60.000041
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.670.000464
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.930.000273
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.1.1740.003378
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.160.320.004292
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.3110.000275
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.4740.001901
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11B.400.000364