CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = E392del

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3392E392delE1210deldelGAA---39839813893-3895

Details of the mutation E392del within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---398398All0.000076
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---144144B.1.177.860.026417
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---5454B.1.1.4421
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---2626AY.40.00004
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---2121B.1.1.70.000019
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---1313B.10.000119
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---1313B.1.20.000114
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---1111B.1.617.20.000041
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---1010B.1.1.2320.018149
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---77AY.440.000043
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---55AY.260.000142
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33A.10.000846
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33AY.160.001139
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33AY.230.000209
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---33R.10.00027
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22AY.390.000049
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22AY.430.000009
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22B.1.1.2000.014925
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22B.1.1.2690.002706
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22B.1.5260.000047
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22P.10.000032
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.130.000161
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.290.000016
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.50.000021
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11AY.60.000041
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.1350.004695
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.1400.018868
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.2230.002778
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.340.013699
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11B.570.015152
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11C.370.000116
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11D.20.000075
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11N.60.007092
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp3392E392delGAA---11W.40.001351