CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = D271G

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3271D271GD1089GnonsyngAtgGt4174040.9688253530-3532
ORF1ab/nsp3271D271GD1089GnonsyngATgGA417100.02398083530-3532
ORF1ab/nsp3271D271GD1089GnonsyngATgGC41730.007194243530-3532

Details of the mutation D271G within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt404417All0.000077
ORF1ab/nsp3271D271GgATgGA10417All0.000002
ORF1ab/nsp3271D271GgATgGC3417All0.000001
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt9798B.1.1.70.000087
ORF1ab/nsp3271D271GgATgGC198B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt6363AY.40.000098
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt3333AY.30.000328
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt2828B.1.617.20.000105
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt1323P.10.000205
ORF1ab/nsp3271D271GgATgGA1023P.10.000158
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt99AY.46.40.001481
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt88AY.440.000049
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt77B.1.2210.000497
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66AY.1000.000276
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66AY.1020.000159
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66AY.200.000233
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66AY.250.000036
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66AY.260.00017
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt66B.1.2400.001293
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt55AY.390.000124
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt55B.1.5170.002135
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt44AY.1170.000338
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt44AY.290.000063
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt23AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp3271D271GgATgGC13AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.230.000139
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22B.10.000018
ORF1ab/nsp3271D271GgATgGC12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt12B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22B.1.1.630.000772
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt22B.60.00182
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.270.000065
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.380.000499
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.770.001127
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11AY.90.000068
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.1.100.001115
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.1.1710.003676
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.1.2180.007692
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.1.2400.004695
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.1.3490.010309
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3271D271GgAtgGt11Q.30.000145