CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = D1875D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31875D1875DD2693DsyngaCgaT4739473918342-8344

Details of the mutation D1875D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT47394739All0.000906
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11451145B.1.1.70.001025
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT239239AY.40.000372
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT194194B.1.3510.005767
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT175175B.1.1770.002304
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT160160B.1.20.001409
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT150150P.10.002363
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT148148B.1.617.20.000557
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT127127B.10.001163
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT123123AY.39.10.004872
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT117117AY.250.000704
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT112112AY.1030.000695
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT110110AY.440.00067
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT109109AY.46.40.017931
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT104104AY.200.004042
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT9090AY.430.000399
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT8585B.1.5430.85
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT6767B.1.2210.004759
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT6666AY.30.000656
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5858AY.1020.001538
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5757AE.80.027873
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5353B.1.1.5190.002105
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5151AY.390.00126
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5151AY.850.021786
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4545B.1.177.820.02148
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4343AY.750.002409
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4242B.1.10.000762
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4141B.1.6090.019655
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4040AD.20.008758
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3434AY.1060.011386
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3333AY.260.000934
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3131AY.610.003248
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3030B.1.1600.000936
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2929AY.340.002812
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2828B.1.5260.000658
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2323B.1.4290.000541
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2222AY.1000.001012
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2121P.1.140.001004
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1919AY.4.50.002042
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1818AY.1200.000669
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1818AY.420.000724
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1818B.1.1.2220.003672
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1717AY.230.001186
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1717B.1.1.2400.079812
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1616AY.790.01937
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1616AY.840.006999
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1515B.1.4270.000757
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1212AY.140.001056
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1212AY.4.20.00026
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1212B.1.1.3680.037037
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1111AY.480.005116
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010B.1.1.500.006789
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010B.1.360.001459
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010B.1.6370.000731
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010C.370.001161
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010P.20.001866
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT99B.1.351.10.346154
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT99P.1.70.002874
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT88AY.270.000518
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT88AY.5.40.002214
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77AY.330.000467
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77B.1.258.170.000728
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77R.10.00063
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.290.000095
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.540.000572
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.60.000247
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.90.000406
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66D.20.00045
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.450.000608
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.710.002375
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.880.004421
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.910.003652
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.1.2160.004452
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.5030.012438
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44AY.950.003044
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B0.000511
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.1.2690.005413
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.1.630.001543
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.177.430.005908
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.2340.000528
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.36.170.001976
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.60.00364
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44Q.10.000505
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33A0.001161
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.1140.000693
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.116.10.000934
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.320.001597
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.360.000445
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.5.30.001012
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.70.000588
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.1.2980.002586
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.1.4160.002715
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.1.540.009063
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.177.100.002634
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.177.210.000229
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.177.50.003727
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.5240.004219
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.5560.022556
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1040.003968
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.470.000062
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.640.00119
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.2430.008163
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.2550.006061
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.2790.002242
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.160.70.004158
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.177.790.004684
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.221.10.005814
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.930.001867
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11A.280.002646
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AL.10.012987
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2290.005747
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2580.003257
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3020.002075
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.5070.008696
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1260.001276
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.410.0025
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1780.02381
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2540.025
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2930.0125
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3400.004292
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4060.006061
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4240.008065
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4520.013699
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4670.04
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4710.002732
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.5390.017544
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.6310.003367
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.30.000831
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.310.003731
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.160.00106
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.180.002591
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.390.018868
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11N.90.005952
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11Q.30.000145