CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = D1584D

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31584D1584DD2402DsyngaCgaT1619161917469-7471

Details of the mutation D1584D within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT16191619All0.00031
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT279279B.1.1.70.00025
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT189189AY.40.000294
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT142142B.1.20.00125
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT8181AY.250.000487
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT7979B.1.4680.451429
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT6565AY.410.019106
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT6161B.1.617.20.00023
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT4646P.10.000725
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT4545AY.540.004291
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT3030AY.290.000473
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2727AY.1030.000168
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2626B.1.5260.000611
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2525AY.330.001669
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2525B.1.4290.000588
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2525D.20.001876
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2424AY.1020.000636
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2222AY.430.000097
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT2020B.1.416.10.03125
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1818AY.1180.001128
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1616AY.50.00033
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1515AY.30.000149
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1414AY.730.009315
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1414B.1.10.000254
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1414B.1.1770.000184
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1313B.1.2580.000865
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1212AY.1200.000446
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1111AY.340.001067
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1111AY.440.000067
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1010AY.1190.000353
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT1010B.10.000092
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT99AY.390.000222
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT99AY.950.006849
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT99AY.98.10.000436
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT99B.1.3130.059211
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT99B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT77B.1.1.10.002287
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT66AY.200.000233
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT66AY.260.00017
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT66B.1.351.20.001815
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55AY.39.10.000198
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55B.1.1.5190.000199
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55B.1.177.860.000917
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55B.1.36.290.002587
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55B.1.4881
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55B.1.5760.004533
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT55P.1.70.001596
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT440.222222
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT44B.1.360.000584
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT33AY.150.006667
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT33AY.230.000209
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT33B.1.1460.012712
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT33Q.10.000379
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.46.60.000144
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.520.001629
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.590.001059
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.610.00021
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.680.000547
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.750.000112
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.980.000158
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22AY.990.002099
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.1.1700.002494
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.1.2040.006079
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.1.4200.002012
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.177.530.004785
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT22C.360.001821
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11A.2.5.10.004808
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.450.000122
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.470.000031
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.970.001701
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.99.10.001553
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.1480.008772
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.2320.001815
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.3170.000412
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.3220.008772
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.177.670.007634
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.177.720.00339
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.2760.016949
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.3500.002933
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.3670.000792
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.4620.007246
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.617.30.002985
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.6360.006711
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11C.10.002392
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11C.180.002591
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11C.370.000116
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp31584D1584DgaCgaT11P.20.000187