CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : Mut = A264A

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3264A264AA1082AsyngcCgcT134412020.8943453509-3511
ORF1ab/nsp3264A264AA1082AsyngcCgcA13441330.09895833509-3511
ORF1ab/nsp3264A264AA1082AsyngcCgcG134490.006696433509-3511

Details of the mutation A264A within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT12021344All0.00023
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA1331344All0.000025
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG91344All0.000002
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT295388B.1.1.70.000264
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA93388B.1.1.70.000083
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT153153B.1.6370.01118
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT8081AY.50.001652
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG181AY.50.000021
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT7172AY.1030.000441
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA172AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT5152AY.440.00031
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA152AY.440.000006
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT4750AY.30.000467
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA350AY.30.00003
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT4848AY.1130.006835
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT3233AY.40.00005
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA133AY.40.000002
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT3333C.370.00383
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT3031B.1.617.20.000113
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG131B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT2626P.1.150.006041
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1824B.10.000165
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA524B.10.000046
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG124B.10.000009
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1724B.1.20.00015
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA724B.1.20.000062
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1923AY.430.000084
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA423AY.430.000018
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT2222B.1.771
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1718AY.250.000102
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA118AY.250.000006
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1314B.1.10.000236
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG114B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1414P.1.140.000669
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1313B.1.177.70.002143
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT99B.1.5960.000784
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT69P.10.000095
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG29P.10.000032
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA19P.10.000016
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT77AY.1170.000592
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT77AY.1180.000439
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT77AY.120.002212
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT57AY.450.000608
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA27AY.450.000243
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT66AY.1000.000276
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT66B.1.2430.000418
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT66B.1.4290.000141
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT66B.1.6280.002114
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT55AY.140.00044
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA35AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT25AY.4.20.000043
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT55AY.75.10.000902
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA24AY.290.000032
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT14AY.290.000016
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG14AY.290.000016
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT44AY.99.20.000369
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT44B.1.6210.000354
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33AY.160.001139
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33AY.260.000085
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33B.1.4090.002344
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33B.1.5260.000071
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA33Q.80.000495
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22AY.200.000078
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22AY.60.000082
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22AY.800.002257
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG12B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA12B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22B.1.415.10.015152
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22D.20.00015
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22N.30.011628
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT22R.10.00018
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.130.000161
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.330.000067
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.390.000025
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.460.000104
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.470.000031
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcG11AY.610.000105
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.970.001701
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AY.990.001049
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11AZ.60.008403
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1.2210.010101
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1.2290.005747
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1.2850.006536
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1.5240.020833
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.36.250.002208
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.30.000831
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.400.000364
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11B.610.005747
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcA11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11P.1.60.001946
ORF1ab/nsp3264A264AgcCgcT11W.30.005263