CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 815 & Codon = gaA

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3815E815EE1633EsyngaGgaA55255215162-5164

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA552552All0.000106
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA252252AY.1110.046154
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA6363B.1.1.70.000056
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA4949R.10.00441
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA2323B.1.3510.000684
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA1515AY.1130.002136
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA1313AY.440.000079
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA1212AY.40.000019
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA99B.1.1.2850.058824
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77AY.390.000173
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77B.10.000064
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77P.10.00011
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA66AY.330.000401
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA55B.1.1.1320.074627
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA44AY.430.000018
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.250.000012
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.690.000373
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22B0.000256
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22P.40.007605
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.10.000396
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.120.000316
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.60.000041
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.860.00083
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.1.3260.001761
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.3190.003049
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.362.20.004717
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11B.340.013699
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11P.20.000187