CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 815

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3815E815DE1633DnonsyngaGgaT31859318520.999785162-5164
ORF1ab/nsp3815E815DE1633DnonsyngaGgaC3185970.0002197185162-5164
ORF1ab/nsp3815E815EE1633EsyngaGgaA55255215162-5164
ORF1ab/nsp3815E815GE1633GnonsyngAggGg2632610.9923955162-5164
ORF1ab/nsp3815E815GE1633GnonsyngAGgGT26320.007604565162-5164
ORF1ab/nsp3815E815KE1633KnonsynGagAag75720.965162-5164
ORF1ab/nsp3815E815KE1633KnonsynGaGAaA7530.045162-5164
ORF1ab/nsp3815E815delE1633deldelGAG---575715162-5164
ORF1ab/nsp3815E815AE1633AnonsyngAggCg545415162-5164
ORF1ab/nsp3815E815YE1633YnonsynGaGTaT353515162-5164
ORF1ab/nsp3815E815VE1633VnonsyngAggTg282815162-5164
ORF1ab/nsp3815E815XE1633XnonsynGagTag131315162-5164
ORF1ab/nsp3815E815del1E1633del1delgAgg-g830.3755162-5164
ORF1ab/nsp3815E815del1E1633del1delGag-ag830.3755162-5164
ORF1ab/nsp3815E815del1E1633del1delgaGga-820.255162-5164
ORF1ab/nsp3815E815QE1633QnonsynGagCag4415162-5164
ORF1ab/nsp3815E815RE1633RnonsynGAGAGA320.6666675162-5164
ORF1ab/nsp3815E815RE1633RnonsynGAgAGg310.3333335162-5164
ORF1ab/nsp3815E815SE1633SnonsynGAGAGT1115162-5164

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT3185231859All0.006092
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC731859All0.000001
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT3114131141AY.470.968646
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA552552All0.000106
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT327327B.1.617.20.001231
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg261263All0.00005
ORF1ab/nsp3815E815GgAGgGT2263All0
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA252252AY.1110.046154
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg8888B.1.6190.076655
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag7275All0.000014
ORF1ab/nsp3815E815KGaGAaA375All0.000001
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT6365B.1.1.70.000056
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC265B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA6363B.1.1.70.000056
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---5757All0.000011
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg5454All0.00001
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA4949R.10.00441
ORF1ab/nsp3815E815YGaGTaT3535All0.000007
ORF1ab/nsp3815E815YGaGTaT3535AY.470.001089
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg3030D.20.002251
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg2828All0.000005
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2425AY.40.000037
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC125AY.40.000002
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2525AY.610.002619
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2525B.1.1.2220.0051
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2424AY.430.000106
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA2323B.1.3510.000684
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg2222AY.1030.000137
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT2222AY.650.011727
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg1919P.10.000299
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg1818AY.40.000028
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT1717AY.30.000169
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA1515AY.1130.002136
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT1515AY.400.014465
ORF1ab/nsp3815E815XGagTag1313All0.000002
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT1313AY.250.000078
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag1313AY.40.00002
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA1313AY.440.000079
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA1212AY.40.000019
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---1212B.1.1.70.000011
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg1111B.1.1.70.00001
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag1011B.1.1.70.000009
ORF1ab/nsp3815E815KGaGAaA111B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg1010B.1.6210.000885
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag1010P.10.000158
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg99AY.430.00004
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT99AY.9.10.000754
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT89B.10.000073
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC19B.10.000009
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA99B.1.1.2850.058824
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg99B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp3815E815del1gAgg-g38All0.000001
ORF1ab/nsp3815E815del1Gag-ag38All0.000001
ORF1ab/nsp3815E815del1gaGga-28All0
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag88AY.1030.00005
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg88AY.30.00008
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg88AY.540.000763
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT88AY.75.10.001442
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77AY.1090.005178
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77AY.120.20.008997
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77AY.390.000173
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77AY.540.000667
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77B0.000895
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77B.10.000064
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---77B.10.000064
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT77B.1.36.80.007
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA77P.10.00011
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA66AY.330.000401
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg66AY.40.000009
ORF1ab/nsp3815E815XGagTag66B.10.000055
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA66B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55AY.260.000142
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55AY.300.001979
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55AY.620.002179
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA55B.1.1.1320.074627
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg55B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag55B.1.177.830.007407
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---440.222222
ORF1ab/nsp3815E815QGagCag44All0.000001
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.130.000644
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA44AY.430.000018
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag34AY.430.000013
ORF1ab/nsp3815E815KGaGAaA14AY.430.000004
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag44AY.440.000024
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT44AY.440.000024
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA44AY.9.20.000147
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA44B.1.4270.000202
ORF1ab/nsp3815E815RGAGAGA23All0
ORF1ab/nsp3815E815RGAgAGg13All0
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg33AY.1020.00008
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg33AY.250.000018
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg33AY.390.000074
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---33AY.430.000013
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg23AY.440.000012
ORF1ab/nsp3815E815GgAGgGT13AY.440.000006
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT33AY.450.000365
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT33AY.750.000168
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg33AY.920.000862
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg33B.1.6370.000219
ORF1ab/nsp3815E815XGagTag220.111111
ORF1ab/nsp3815E815del1gAgg-g220.111111
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.100.00106
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.200.000078
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.230.000139
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.250.000012
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.30.00002
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.330.000134
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.330.000134
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.39.10.000079
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg22AY.40.000003
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---22AY.40.000003
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp3815E815RGAgAGg12AY.430.000004
ORF1ab/nsp3815E815RGAGAGA12AY.430.000004
ORF1ab/nsp3815E815del1Gag-ag22AY.440.000012
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22AY.690.000373
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg22AY.980.000158
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22B0.000256
ORF1ab/nsp3815E815XGagTag22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22B.1.1.3980.006452
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp3815E815QGagCag22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA22P.40.007605
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp3815E815QGagCag11A.90.045455
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---11AH.30.003802
ORF1ab/nsp3815E815SGAGAGT11All0
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.10.000396
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.116.10.000311
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.120.000316
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3815E815del1Gag-ag11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3815E815KGagAag11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg11AY.440.000006
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp3815E815VgAggTg11AY.470.000031
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.570.000656
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaC11AY.60.000041
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.60.000041
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.670.000464
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp3815E815delGAG---11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3815E815del1gAgg-g11AY.790.001211
ORF1ab/nsp3815E815AgAggCg11AY.840.000437
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.840.000437
ORF1ab/nsp3815E815EgaGgaA11AY.860.00083
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.90.000068
ORF1ab/nsp3815E815DgaGgaT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3815E815GgAggGg11AY.920.000287
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