CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | M1586I | nonsyn | atG | atA | 10612 | 6864 | 0.646815 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | M1586I | nonsyn | atG | atT | 10612 | 3709 | 0.34951 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | M1586I | nonsyn | atG | atC | 10612 | 39 | 0.00367508 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | M1586V | nonsyn | Atg | Gtg | 199 | 198 | 0.994975 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | M1586V | nonsyn | AtG | GtA | 199 | 1 | 0.00502513 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | M1586T | nonsyn | aTg | aCg | 110 | 103 | 0.936364 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | M1586T | nonsyn | aTG | aCA | 110 | 6 | 0.0545455 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | M1586T | nonsyn | aTG | aCC | 110 | 1 | 0.00909091 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | M1586del | del | ATG | --- | 97 | 97 | 1 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | M1586L | nonsyn | Atg | Ctg | 83 | 55 | 0.662651 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | M1586L | nonsyn | Atg | Ttg | 83 | 25 | 0.301205 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | M1586L | nonsyn | AtG | TtA | 83 | 2 | 0.0240964 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | M1586L | nonsyn | AtG | CtT | 83 | 1 | 0.0120482 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | M1586K | nonsyn | aTg | aAg | 40 | 40 | 1 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | M1586R | nonsyn | aTg | aGg | 20 | 20 | 1 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | M1586del1 | del | aTg | a-g | 6 | 3 | 0.5 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | M1586del1 | del | atG | at- | 6 | 2 | 0.333333 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | M1586del1 | del | AtG | Gt- | 6 | 1 | 0.166667 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | M1586del2 | del | ATg | --g | 4 | 2 | 0.5 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | M1586del2 | del | aTG | a-- | 4 | 1 | 0.25 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | M1586del2 | del | ATG | --T | 4 | 1 | 0.25 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768C | M1586C | nonsyn | ATG | TGC | 3 | 3 | 1 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768A | M1586A | nonsyn | ATg | GCg | 1 | 1 | 1 | 5021-5023 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768E | M1586E | nonsyn | ATg | GAg | 1 | 1 | 1 | 5021-5023 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 6864 | 10612 | All | 0.001313 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3709 | 10612 | All | 0.000709 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 39 | 10612 | All | 0.000007 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 6673 | 6673 | Q.3 | 0.967803 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1182 | 1195 | AY.43 | 0.005237 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 13 | 1195 | AY.43 | 0.000058 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 556 | 556 | B.1.177.52 | 0.977153 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 343 | 449 | B.1.1.7 | 0.000307 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 97 | 449 | B.1.1.7 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 9 | 449 | B.1.1.7 | 0.000008 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 337 | 340 | AY.44 | 0.002051 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 3 | 340 | AY.44 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 198 | 199 | All | 0.000038 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | AtG | GtA | 1 | 199 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 158 | 163 | B.1.617.2 | 0.000595 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 5 | 163 | B.1.617.2 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 119 | 133 | AY.4 | 0.000185 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 14 | 133 | AY.4 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 103 | 110 | All | 0.00002 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTG | aCA | 6 | 110 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTG | aCC | 1 | 110 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 97 | 97 | All | 0.000019 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 87 | 90 | B.1.2 | 0.000766 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 90 | B.1.2 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 90 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 55 | 83 | All | 0.000011 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 25 | 83 | All | 0.000005 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | AtG | TtA | 2 | 83 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | AtG | CtT | 1 | 83 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 77 | 77 | Y.1 | 0.987179 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 71 | 76 | B.1.177 | 0.000935 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 3 | 76 | B.1.177 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 76 | B.1.177 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 76 | 76 | B.1.526 | 0.001786 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 49 | 49 | AY.102 | 0.001299 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | aTg | aAg | 40 | 40 | All | 0.000008 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 36 | 39 | AY.103 | 0.000224 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 3 | 39 | AY.103 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 36 | 37 | AY.39 | 0.00089 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 37 | AY.39 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | aTg | aAg | 36 | 36 | P.1 | 0.000567 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 35 | 35 | B.1.526 | 0.000823 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 33 | 33 | AY.119 | 0.001165 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 32 | 33 | B.1.1.7 | 0.000029 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTG | aCC | 1 | 33 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 32 | 32 | AY.3 | 0.000318 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 31 | 31 | AY.113 | 0.004414 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 27 | 31 | AY.25 | 0.000162 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 4 | 31 | AY.25 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 26 | 30 | B.1 | 0.000238 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 4 | 30 | B.1 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 28 | 28 | B.1.1.7 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 28 | 28 | P.1 | 0.000441 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 27 | 27 | AY.4 | 0.000042 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 20 | 22 | AY.26 | 0.000566 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 22 | AY.26 | 0.000057 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 22 | 22 | B.1.1.7 | 0.00002 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 20 | 20 | All | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 19 | 19 | AY.7 | 0.003724 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 15 | 18 | AY.9 | 0.001014 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 18 | AY.9 | 0.000135 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 18 | AY.9 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 16 | 16 | B.1 | 0.000147 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 15 | 15 | B.1.1.519 | 0.000596 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 14 | 14 | AY.121 | 0.001894 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 14 | 14 | AY.43 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 14 | 14 | AY.5 | 0.000289 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 14 | 14 | B.1.243 | 0.000974 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 12 | 13 | AY.20 | 0.000466 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 13 | AY.20 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 8 | 13 | B.1.1 | 0.000145 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 4 | 13 | B.1.1 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 13 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 12 | 12 | AY.100 | 0.000552 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 12 | 12 | AY.4 | 0.000019 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 8 | 12 | B.1.1.7 | 0.000007 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 4 | 12 | B.1.1.7 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 11 | 11 | AY.103 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 11 | 11 | B.1.346 | 0.014417 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 10 | 11 | B.1.351 | 0.000297 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 11 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 10 | 11 | B.1.429 | 0.000235 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 11 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 10 | 10 | AY.20 | 0.000389 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 10 | 10 | B.1.160.20 | 0.089286 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 10 | 10 | R.1 | 0.0009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 9 | 9 | AY.117 | 0.000761 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 9 | 9 | AY.4.5 | 0.000967 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 8 | 8 | AY.44 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 6 | 8 | AY.6 | 0.000247 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 8 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 8 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 8 | 8 | AY.61 | 0.000838 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 8 | 8 | AY.9.1 | 0.00067 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 8 | 8 | B.1.1.33 | 0.003367 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 8 | 8 | B.1.177.24 | 0.010363 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 7 | 7 | AY.119 | 0.000247 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 7 | 7 | AY.75 | 0.000392 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.369 | 0.001997 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.404 | 0.009115 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.561 | 0.002779 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 7 | 7 | B.1.596 | 0.00061 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | aTg | a-g | 3 | 6 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | atG | at- | 2 | 6 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | AtG | Gt- | 1 | 6 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 6 | 6 | AY.103 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 5 | 6 | AY.9.2 | 0.000184 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 6 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 6 | 6 | B.1.1.251 | 0.047619 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 5 | 6 | B.1.1.284 | 0.000537 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 6 | B.1.1.284 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 6 | B.1.160 | 0.000125 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 6 | B.1.160 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 6 | 6 | C.37 | 0.000696 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 5 | 5 | AE.1 | 0.056818 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 5 | 5 | AY.14 | 0.00044 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 5 | 5 | AY.26 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 5 | AY.29 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 5 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 5 | 5 | AY.42 | 0.000201 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 5 | 5 | AY.43 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 4 | 5 | AY.46 | 0.000416 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 5 | AY.46 | 0.000104 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 5 | AY.75.1 | 0.000721 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 5 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 5 | 5 | B.1.617.1 | 0.000645 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 5 | 5 | Q.6 | 0.033113 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 4 | 4 | 0.222222 | |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | AtG | TtA | 2 | 4 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 2 | 4 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | ATg | --g | 2 | 4 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | aTG | a-- | 1 | 4 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | ATG | --T | 1 | 4 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 4 | 4 | AY.102 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 4 | AY.111 | 0.000733 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 4 | AY.36 | 0.000593 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 4 | AY.45 | 0.000487 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 4 | 4 | AY.46.4 | 0.000658 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 4 | 4 | AY.54 | 0.000381 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 4 | AY.78 | 0.006163 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 3 | 4 | B.1 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | AtG | CtT | 1 | 4 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 4 | B.1.1.306 | 0.001315 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 4 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 4 | 4 | B.1.1.348 | 0.003185 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 4 | 4 | B.1.2 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 4 | 4 | B.1.2 | 0.000035 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 4 | 4 | B.1.36 | 0.000584 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 4 | 4 | B.1.617.2 | 0.000015 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 4 | 4 | P.1.14 | 0.000191 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768C | ATG | TGC | 3 | 3 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 3 | 3 | AY.116.1 | 0.000934 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 3 | 3 | AY.25 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 3 | AY.33 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 3 | AY.33 | 0.000067 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | AY.34 | 0.000291 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 3 | 3 | AY.34.1 | 0.00153 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | AY.41 | 0.000882 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 3 | 3 | AY.43 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 3 | AY.47 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 3 | AY.47 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 3 | AY.98.1 | 0.000097 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 3 | AY.98.1 | 0.000048 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | AY.99.2 | 0.000276 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 3 | 3 | B.1.1 | 0.000054 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.1.25 | 0.001706 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768C | ATG | TGC | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 3 | 3 | B.1.177 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 2 | 3 | B.1.177 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTG | aCA | 1 | 3 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 3 | 3 | B.1.177.4 | 0.000633 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | B.1.36.17 | 0.001482 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 3 | B.1.427 | 0.000101 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 3 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 3 | 3 | B.1.617.2 | 0.000011 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | D.2 | 0.000225 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 3 | 3 | P.1.15 | 0.000697 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 3 | 3 | P.1.7 | 0.000958 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTG | aCA | 3 | 3 | Q.3 | 0.000435 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTG | aCA | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 2 | A.2.5.1 | 0.009615 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | AE.8 | 0.000978 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 2 | 2 | AY.102 | 0.000053 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 2 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 1 | 2 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 2 | 2 | AY.113 | 0.000285 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | AY.117 | 0.000169 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | AY.120 | 0.000074 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 2 | 2 | AY.23 | 0.000139 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 2 | 2 | AY.25 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | AY.33 | 0.000134 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | AY.39.1 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 2 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 2 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | AY.4.2.1 | 0.000298 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 2 | 2 | AY.43 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | AY.59 | 0.001059 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 2 | 2 | AY.61 | 0.00021 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | AY.8 | 0.001212 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | AY.91 | 0.001461 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 2 | 2 | B.1.1 | 0.000036 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 2 | 2 | B.1.1.115 | 0.017857 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.28 | 0.000622 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.1.311 | 0.000716 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.177.4 | 0.000422 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | B.1.177.73 | 0.001133 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 2 | 2 | B.1.2 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.234 | 0.000264 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.258 | 0.000133 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 2 | 2 | B.1.36 | 0.000292 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.36 | 0.000292 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.36.2 | 0.021505 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | B.1.429 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | B.1.444 | 0.031746 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | aTg | a-g | 1 | 2 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | AtG | Gt- | 1 | 2 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | B.1.623 | 0.001073 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | C.35 | 0.001548 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | Q.1 | 0.000253 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 2 | 2 | Q.1 | 0.000253 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 2 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 2 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 2 | 2 | Q.8 | 0.00033 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 2 | 2 | R.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 2 | 2 | S.1 | 0.009901 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | A.2.2 | 0.001689 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | A.2.2 | 0.001689 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | A.25 | 0.018182 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AD.2 | 0.000219 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768A | ATg | GCg | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768E | ATg | GAg | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.105 | 0.000643 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | AY.106 | 0.000335 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.109 | 0.00074 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.110 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.113 | 0.000142 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.115 | 0.005208 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.118 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | AY.16 | 0.00038 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.3 | 0.00001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | AY.3.1 | 0.000085 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.32 | 0.000532 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.38 | 0.000499 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | aTG | a-- | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | AY.4.5 | 0.000107 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | AY.40 | 0.000964 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ttg | 1 | 1 | AY.43 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | aTg | aAg | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.44 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.46.2 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.46.6 | 0.000072 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.48 | 0.000465 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | ATg | --g | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 1 | AY.54 | 0.000095 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.55 | 0.000917 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.6 | 0.000041 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.60 | 0.000938 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.65 | 0.000533 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | AY.66 | 0.00107 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | AY.66 | 0.00107 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.7.1 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | AY.7.2 | 0.000559 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.70 | 0.000209 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.74 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | AY.75 | 0.000056 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | AY.75.1 | 0.00018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.87 | 0.000833 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AY.91 | 0.00073 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | AY.99.1 | 0.001553 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AZ.2 | 0.000821 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | AZ.5 | 0.003509 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | aTg | a-g | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | aTg | aAg | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | B.1.1 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | B.1.1.1 | 0.000327 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.101 | 0.01 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.1.139 | 0.022727 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.1.142 | 0.017544 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.207 | 0.001182 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.217 | 0.003636 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.1.218 | 0.007692 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.261 | 0.008621 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | B.1.1.28 | 0.000311 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | atG | at- | 1 | 1 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.1.315 | 0.008475 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.326 | 0.001761 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | B.1.1.326 | 0.001761 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.1.37 | 0.000193 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | B.1.1.39 | 0.00051 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | B.1.1.434 | 0.000349 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.1.448 | 0.002033 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.50 | 0.000679 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.1.519 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768E | ATg | GAg | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | aTg | aAg | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.1.95 | 0.019608 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atC | 1 | 1 | B.1.1.97 | 0.029412 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.128 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.140 | 0.018868 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | AtG | GtA | 1 | 1 | B.1.157 | 0.002985 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.44 | 0.000519 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.177.54 | 0.000606 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.57 | 0.000281 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.177.6 | 0.000977 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | B.1.177.6 | 0.000977 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.177.62 | 0.001192 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.177.68 | 0.015152 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768K | aTg | aAg | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | ATg | --g | 1 | 1 | B.1.221 | 0.000071 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.23 | 0.006061 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | B.1.236 | 0.002053 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.239 | 0.001221 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | aTg | a-g | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.265 | 0.001271 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | B.1.281 | 0.021739 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.319 | 0.003049 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | B.1.340 | 0.004292 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.350 | 0.002933 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.351.1 | 0.038462 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del1 | atG | at- | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.36.18 | 0.00042 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | B.1.36.29 | 0.000517 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.375 | 0.00082 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.396 | 0.000706 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.409 | 0.000781 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.415 | 0.014286 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.415.1 | 0.007576 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.416.1 | 0.001563 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | B.1.433 | 0.003195 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.470 | 0.001404 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.525 | 0.000113 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.538 | 0.008065 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.558 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.560 | 0.00463 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.565 | 0.00081 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.575 | 0.000303 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | B.1.576 | 0.000907 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.614 | 0.125 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del2 | ATG | --T | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | B.1.617.1 | 0.000129 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768A | ATg | GCg | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.1.621 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | B.15 | 0.017544 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768T | aTg | aCg | 1 | 1 | B.3 | 0.000831 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atA | 1 | 1 | B.57 | 0.015152 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | C.1.2 | 0.004255 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | C.36 | 0.000911 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768del | ATG | --- | 1 | 1 | C.37 | 0.000116 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768R | aTg | aGg | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | P.1.15 | 0.000232 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768V | Atg | Gtg | 1 | 1 | P.2 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768I | atG | atT | 1 | 1 | P.2 | 0.000187 |
ORF1ab/nsp3 | 768 | M768L | Atg | Ctg | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|