CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 697 & Codon = tTc

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3697S697FS1515FnonsyntCctTc127412730.9992154808-4810

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc12731274All0.000243
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc316316B.1.1.70.000283
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc216216B.1.6180.870968
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc8686B.1.1770.001132
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc8080B.1.20.000704
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc5252B.10.000476
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc3535AY.40.000054
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2929AY.440.000177
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2626AY.460.002706
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2626B.1.1260.033163
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2525B.1.617.20.000094
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2424AY.430.000106
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2323AY.250.000138
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2222B.1.5250.00249
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2121AY.200.000816
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc2020AY.1200.000744
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc1717AY.30.000169
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc1616B.1.4800.039801
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc1616C.370.001857
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc1515B.1.5820.00736
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc1212AY.1030.000075
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc1212B.1.177.810.002272
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc99AY.860.007469
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc99P.10.000142
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc88AY.360.001186
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc88Q.10.001011
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc77AY.750.000392
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc77B.1.2580.000466
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc66AY.1180.000376
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc66AY.670.002786
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc55B.1.1.390.002548
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc44AY.1210.000541
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc44AY.470.000124
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc44B.1.1.2940.005063
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc44B.1.2350.010076
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc44B.1.6280.001409
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc33AY.260.000085
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc33AY.4.20.000065
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc33AY.4.40.001227
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc120.055556
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22AY.116.10.000623
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22AY.120.000632
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22AY.290.000032
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22AY.50.000041
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22AY.690.000373
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.177.800.003824
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.3990.003868
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22B.1.619.10.001283
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.140.000088
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.390.000025
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.420.00004
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.790.001211
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.820.001357
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B0.000128
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.1.2980.000862
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.1690.014925
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.2800.007143
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.428.30.012821
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.4480.002625
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.5300.007143
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11P.1.20.001156
ORF1ab/nsp3697S697FtCctTc11P.20.000187