CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 616 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3616L616delL1434deldelCTT---626214565-4567

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---6262All0.000012
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---2020B.1.1.70.000018
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---33AY.420.000121
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---22B.10.000018
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---22P.10.000032
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11A0.000387
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11AY.50.000021
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11AY.520.000814
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.1.1420.017544
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.177.760.002494
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.3190.003049
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11B.150.017544
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11P.1.40.000977
ORF1ab/nsp3616L616delCTT---11R.10.00009