CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 608

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3608T608TT1426TsynacCacT52311518710.9915894541-4543
ORF1ab/nsp3608T608TT1426TsynacCacA523114340.008296534541-4543
ORF1ab/nsp3608T608TT1426TsynacCacG5231160.0001146994541-4543
ORF1ab/nsp3608T608NT1426NnonsynaCcaAc1511500.9933784541-4543
ORF1ab/nsp3608T608NT1426NnonsynaCCaAT15110.006622524541-4543
ORF1ab/nsp3608T608delT1426deldelACC---11011014541-4543
ORF1ab/nsp3608T608IT1426InonsynaCcaTc30280.9333334541-4543
ORF1ab/nsp3608T608IT1426InonsynaCCaTT3020.06666674541-4543
ORF1ab/nsp3608T608ST1426SnonsynAccTcc20160.84541-4543
ORF1ab/nsp3608T608ST1426SnonsynaCcaGc2030.154541-4543
ORF1ab/nsp3608T608ST1426SnonsynaCCaGT2010.054541-4543
ORF1ab/nsp3608T608AT1426AnonsynAccGcc141414541-4543
ORF1ab/nsp3608T608HT1426HnonsynACcCAc2214541-4543
ORF1ab/nsp3608T608KT1426KnonsynaCCaAA2214541-4543
ORF1ab/nsp3608T608YT1426YnonsynACcTAc210.54541-4543
ORF1ab/nsp3608T608YT1426YnonsynACCTAT210.54541-4543
ORF1ab/nsp3608T608del1T1426del1delACC-NN1114541-4543
ORF1ab/nsp3608T608RT1426RnonsynaCCaGA1114541-4543
ORF1ab/nsp3608T608PT1426PnonsynAccCcc1114541-4543
ORF1ab/nsp3608T608MT1426MnonsynaCCaTG1114541-4543

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT5187152311All0.009921
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA43452311All0.000083
ORF1ab/nsp3608T608TacCacG652311All0.000001
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2978529785B.1.1600.928923
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT49574969B.1.1.70.004438
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA114969B.1.1.70.00001
ORF1ab/nsp3608T608TacCacG14969B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT19311931A.2.50.963573
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT10491049B.1.160.160.974907
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT773773B.1.160.80.996134
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT664668AY.40.001033
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA4668AY.40.000006
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA390602AY.1030.002422
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT212602AY.1030.001316
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT599599A.2.5.20.941824
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT587587B.1.160.170.998299
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT539546B.1.617.20.00203
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA6546B.1.617.20.000023
ORF1ab/nsp3608T608TacCacG1546B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT508508B.1.1770.006689
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT481481B.1.160.71
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT468468B.1.160.140.991525
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT411411B.1.160.260.995157
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT346351B.10.003169
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA4351B.10.000037
ORF1ab/nsp3608T608TacCacG1351B.10.000009
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT336336B.1.160.280.982456
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT298298B.1.4270.015048
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT292292B.1.36.10.332953
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT267267L.30.946809
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT261261B.1.20.002298
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT254255AY.440.001546
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA1255AY.440.000006
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT233233B.1.160.290.983122
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT225225B.1.160.240.995575
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT225225B.1.160.330.995575
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT219219P.10.00345
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT207207A.2.5.10.995192
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT207207B.1.160.231
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT202202B.1.160.151
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT201201B.1.160.300.598214
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT187187B.1.160.320.802575
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT171173AY.430.000758
ORF1ab/nsp3608T608TacCacG2173AY.430.000009
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT173173B.1.160.110.988571
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT168168B.1.5610.066693
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT167167B.1.4290.003929
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT155155B.1.160.120.99359
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc150151All0.000029
ORF1ab/nsp3608T608NaCCaAT1151All0
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT146146B.1.160.220.986486
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT136136B.1.160.90.978417
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT127127B.1.160.180.927007
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT123123B.1.160.310.991935
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT120120AB.10.983607
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT119119AY.1130.016944
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT118118AY.1000.005429
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT115115B.1.160.100.927419
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT115115B.1.5260.002703
ORF1ab/nsp3608T608delACC---110110All0.000021
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT106106B.1.10.001923
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT9292A.2.5.30.948454
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT9090B.1.160.251
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT8181B.1.160.200.723214
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT7575AY.250.000451
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT7575B.1.1.5190.002978
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT7373AY.1020.001936
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT7272B.1.2210.005114
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT7071AY.30.000696
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA171AY.30.00001
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT6868B.1.3510.002021
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT6565B.1.160.270.984848
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT6363AE.80.030807
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT5959B.1.466.20.023083
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT5555B.1.1.2770.04173
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT5151B.1.4730.980769
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT5050B.1.6370.003654
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT4848AY.470.001493
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc4646AY.40.000072
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT4646AY.50.00095
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT4444B0.005624
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT4343B.1.177.310.494253
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT4040AY.260.001132
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT4040B.1.160.210.816327
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3939B.1.177.440.020239
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3536AY.1200.001301
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA136AY.1200.000037
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3636B.1.160.131
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3636B.1.2410.029221
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3535B.1.177.860.006421
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3434B.1.177.540.020619
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3333AY.60.001357
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT3232AY.98.10.00155
ORF1ab/nsp3608T608delACC---3131B.1.1.70.000028
ORF1ab/nsp3608T608IaCcaTc2830All0.000005
ORF1ab/nsp3608T608IaCCaTT230All0
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2929AY.70.005684
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2929B.1.2430.002018
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2929B.1.6010.878788
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2828B.1.160.191
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2626B.1.1.4200.026157
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2626B.1.1.4450.962963
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2626B.1.177.570.007305
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2626P.1.150.006041
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc2525B.1.1.70.000022
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2324AY.1170.001944
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA124AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2324AY.390.000568
ORF1ab/nsp3608T608TacCacG124AY.390.000025
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2323P.1.120.011133
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2222B.1.177.600.004806
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2121B.1.4090.016406
ORF1ab/nsp3608T608SAccTcc1620All0.000003
ORF1ab/nsp3608T608SaCcaGc320All0.000001
ORF1ab/nsp3608T608SaCCaGT120All0
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2020B.1.1.390.010194
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT2020B.1.258.110.007927
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1919AY.46.60.001372
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1717Q.10.002148
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1616B.1.36.380.026273
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1515B.1.5750.004551
ORF1ab/nsp3608T608AAccGcc1414All0.000003
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1414AY.1190.000494
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1414AY.230.000976
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1414B.1.177.430.020679
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1414B.1.2340.001847
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1314B.1.6210.001151
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA114B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1414C.370.001625
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1213B.1.2580.000799
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA113B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1313B.1.360.001897
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1313B.1.617.10.001677
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1212AY.290.000189
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1212AY.420.000483
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1212B.1.1.280.003735
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1212C.140.051948
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1111AY.1210.001488
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT611B.1.5090.005195
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA511B.1.5090.004329
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010AY.200.000389
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.1.2220.00204
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.1.2940.012658
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.177.40.002111
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.3110.002746
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.438.10.001073
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.5050.04386
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT1010B.1.5250.001132
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT99AY.940.003984
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT99B.1.177.810.001704
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc99B.1.3620.013867
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT99B.1.4110.033333
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT99Q.40.004093
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT99R.10.00081
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc88AY.200.000311
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT88AY.340.000776
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT88AY.46.40.001316
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT78B.1.1.2140.000388
ORF1ab/nsp3608T608TacCacA18B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT88B.1.2320.004299
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77A0.002709
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77AY.3.10.000597
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77AY.4.20.000152
ORF1ab/nsp3608T608NaCcaAc77AY.440.000043
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77AY.460.000729
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77AY.9.20.000257
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77AY.930.001912
ORF1ab/nsp3608T608delACC---77B.10.000064
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77B.1.1.330.002946
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77B.1.177.730.003964
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77B.1.2600.023411
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77P.1.10.002224
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT77P.1.40.006836
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66AY.4.50.000645
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66B.1.1.3060.00263
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66B.1.1.3680.018519
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66B.1.1.700.002046
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66B.1.177.210.000459
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT66P.1.140.000287
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.100.00265
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.140.00044
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.240.002155
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.320.002662
ORF1ab/nsp3608T608delACC---55AY.40.000008
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.450.000608
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.520.004072
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55B.1.1.1530.005476
ORF1ab/nsp3608T608TacCacT55B.1.1.630.001929
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