CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 597 & Codon = gtT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3597V597VV1415VsyngtGgtT736250670.6882644508-4510

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT50677362All0.000969
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT10201268B.1.1.70.000913
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT492520AY.40.000766
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT262269B.1.4290.006165
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT238239B.1.3510.007075
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT189224AY.440.00115
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT10220B.1.4270.000505
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT174177AY.430.000771
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT174174B.1.1.1960.994286
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT167173B.1.617.20.000629
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT144144B.1.1.5260.510638
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT124131B.1.20.001092
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT95117AY.1030.00059
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT9696R.10.008641
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT6094B.10.00055
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT8990B.1.1.2910.066073
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT7375B.1.1770.000961
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT7374AY.250.000439
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT5461P.10.000851
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT5358AY.30.000527
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT5153AY.470.001586
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4552B.1.10.000816
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1050AY.50.000206
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4850B.1.1.5190.001906
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4545B.1.438.20.865385
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4444AY.99.20.004055
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT4343AY.1020.00114
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3943B.1.360.00569
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3939B.1.5270.144444
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3737AY.4.50.003977
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3636AY.290.000568
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT3535AY.390.000865
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2627AY.200.00101
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2323B.1.221.20.092369
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2323B.1.2580.001531
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2222AY.9.20.000808
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2121B.1.1.3170.008646
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2021B.1.1600.000624
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT2121P.20.003919
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1920AY.330.001269
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1919AY.16.10.008929
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1719B.1.1.3180.00513
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1919B.1.617.10.00245
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1818B.1.1.2560.246575
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1717AY.4.2.10.002533
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1717AY.460.001769
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1717B.1.177.830.025185
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616AY.260.000453
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT316B0.000383
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616B.1.1.2140.000887
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616B.1.1.5280.076923
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1616P.1.170.002588
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1415AY.98.10.000678
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414AY.1180.000877
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT514AY.270.000324
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414AY.300.00554
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414B.1.2400.003018
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1414B.1.4780.164706
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1313B.1.5250.001471
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212AY.480.005581
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212AY.650.006397
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212AY.7.10.001352
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1112B.1.1.3060.004822
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1212B.1.1.630.00463
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1111Q.30.001595
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1010AY.230.000697
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT510AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT1010AY.60.000411
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99AY.420.000362
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99AY.610.000943
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99B.1.466.20.003521
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT99C.370.001045
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88AY.1170.000676
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88AY.1200.000297
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88B.1.2210.000568
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT88B.1.2430.000557
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT77AY.1160.002007
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT77AY.90.000473
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT47B.1.6210.000354
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT56AY.1000.00023
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66AY.1060.002009
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66B.1.1260.007653
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66B.1.130.014252
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT66B.1.3960.004234
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55AY.1210.000677
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.1.1980.007342
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT45B.1.1.370.000771
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.2320.002687
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.3970.024272
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.5260.000118
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55B.1.6090.002397
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT55P.1.60.009728
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.340.000388
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.450.000487
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.670.001857
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.800.004515
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44AY.9.10.000335
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1.3020.008299
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1.3690.001785
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.1700.017241
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.177.820.001909
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.2410.003247
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.3490.002859
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.3670.00317
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT14D.20.000075
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT44P.1.20.004624
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AD.20.000657
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.130.000483
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.140.000264
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.400.002893
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT23AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.46.60.000217
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.510.002727
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.640.001786
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.75.10.000541
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33AY.980.000237
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1.2580.009772
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1.4340.001046
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1030.057692
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.110.30.002155
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.1890.012876
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.2150.028846
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.36.100.014354
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.5950.000783
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.6270.006061
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.1.6310.010101
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33B.400.001093
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT33P.1.140.000143
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22A.10.000564
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22A.2.5.20.003145
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT12AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.370.000632
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.520.001629
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.620.000871
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22AY.700.000417
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT12AY.750.000056
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.2840.000215
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.3040.005618
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.3160.00185
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.4480.004065
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.1.460.008734
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.177.230.006472
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.177.60.001953
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.36.160.002849
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.4560.006536
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.4700.002809
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.5680.002222
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.1.5760.001813
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22B.390.004662
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22C.160.002121
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT12C.360.000911
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT22P.60.006289
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AK.10.012658
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AP.10.001502
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.240.000431
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.39.1.10.000725
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.410.000294
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.560.001605
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.70.000196
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.7.20.000559
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.820.001357
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.940.000443
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.160.055556
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.2240.014286
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.2720.005208
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.3560.008547
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.3770.001381
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.610.008772
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1.740.00431
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1120.005181
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1420.002899
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.1460.004237
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.177.110.001698
ORF1ab/nsp3597V597VgtGgtT11B.1.177.120.000152
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