CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 477 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3477V477IV1295InonsynGttAtt147114700.999324148-4150

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt14701471All0.000281
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt10181018AY.920.292445
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt134134B.1.1.70.00012
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt4747AY.440.000286
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt4747B.10.00043
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt4040AY.40.000062
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt2020B.1.617.20.000075
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt1010AY.250.00006
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt99Q.10.001137
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt88AY.430.000035
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt77AY.450.000852
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt77AY.50.000145
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt66AY.1200.000223
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt66AY.230.000418
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt66AY.390.000148
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt55AY.420.000201
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt55B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt55C.370.00058
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt44B.1.1.4320.005063
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt44B.1.6210.000354
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt44P.10.000063
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33AY.200.000117
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33AY.840.001312
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33B.1.1770.00004
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt120.055556
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22AY.60.000082
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22AY.820.002714
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22B.1.221.30.001667
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.1040.001984
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.4.10.000737
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11AY.870.000833
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.1.1290.009174
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.4030.003268
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11B.150.017544
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp3477V477IGttAtt11P.1.140.000048