CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 404 & Codon = gCt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3404V404AV1222AnonsyngTtgCt1051030.9809523929-3931

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt103105All0.00002
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt1818AY.250.000108
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt1414B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt1111B.1.1770.000145
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt1010B.1.3110.002746
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt99AY.30.00009
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt44AY.430.000018
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt33AY.40.000005
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt33AY.440.000018
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt120.055556
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt22AY.640.00119
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt12AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11AY.810.001992
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11B.10.000009
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11B.400.000364
ORF1ab/nsp3404V404AgTtgCt11P.10.000016