CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 356

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3356Y356YY1174YsyntaCtaT9105910513785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356HY1174HnonsynTacCac3793770.9947233785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356HY1174HnonsynTaCCaT37920.005277053785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356CY1174CnonsyntActGc72710.9861113785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356CY1174CnonsyntACtGT7210.01388893785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356delY1174deldelTAC---424213785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356XY1174XnonsyntaCtaA870.8753785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356XY1174XnonsyntaCtaG810.1253785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356NY1174NnonsynTacAac7713785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356FY1174FnonsyntActTc5513785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356del1Y1174del1deltAct-c3313785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356IY1174InonsynTAcATc320.6666673785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356IY1174InonsynTACATA310.3333333785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356RY1174RnonsynTACCGT210.53785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356RY1174RnonsynTAcCGc210.53785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356SY1174SnonsyntActCc1113785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356LY1174LnonsyntACtTA1113785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356KY1174KnonsynTaCAaA1113785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356del2Y1174del2deltACt--1113785-3787
ORF1ab/nsp3356Y356GY1174GnonsynTAcGGc1113785-3787

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT91059105All0.001741
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT49414941B.1.1.70.004423
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT553553AY.46.60.039931
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac377379All0.000072
ORF1ab/nsp3356Y356HTaCCaT2379All0
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT329329AY.30.003272
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT310310B.1.1.2980.267241
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT256256AY.40.000398
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT229229B.1.20.002016
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT162162B.1.617.20.00061
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT143143AY.440.00087
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT131131B.1.10.002376
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac100100B.1.20.000881
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT9393AY.430.000412
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac9292AY.250.000553
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT9191B.1.1770.001198
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT8686P.1.140.004111
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT7777AY.250.000463
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc7172All0.000014
ORF1ab/nsp3356Y356CtACtGT172All0
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT6969B.10.000632
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT6767AY.390.001656
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT6363B.570.954545
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT5555B.1.5610.021834
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT5454AY.690.01008
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT5252B.1.30.136126
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT4747AY.1030.000292
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT4343AY.360.006373
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---4242All0.000008
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT4141B.1.3510.001219
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT3737AY.1020.000981
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT3737AY.60.001522
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac3636B.1.1.70.000032
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT3535AY.4.20.000759
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT3535P.20.006532
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT3434AY.290.000536
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT3434P.10.000536
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac3030AY.40.000047
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2828AY.270.001812
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac2828C.36.30.015882
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2727B.1.1.4500.931034
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2727B.1.5260.000635
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2626AY.260.000736
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2525B.1.1600.00078
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc2222B.1.1.2690.02977
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2222B.1.2430.001531
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2121B.1.177.810.003976
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac2020AY.4.20.000434
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT2020B.1.2320.010747
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1919B0.002428
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1919P.1.150.004414
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1616AY.50.00033
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1616B.1.1.500.010862
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc1515B.1.617.20.000056
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1414AY.200.000544
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1414B.1.177.440.007265
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1313AY.1200.000483
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1313B.1.1.3650.072626
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1313B.1.1.5190.000516
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1313B.1.360.001897
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1313B.1.5750.003944
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1212B.1.4700.016854
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1111AY.1000.000506
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1111AY.460.001145
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1111B.1.214.20.006595
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1111B.1.2210.000781
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1111B.1.2580.000732
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1111B.1.4290.000259
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010AY.1190.000353
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010AY.470.000311
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010AY.960.020747
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010B.1.1.370.001929
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010B.1.4270.000505
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010B.1.5960.000871
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT1010Q.10.001263
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT99AY.1170.000761
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT99AY.1180.000564
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT99C.370.001045
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT99Q.80.001484
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA78All0.000001
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaG18All0
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT88B.1.1.1760.003515
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT88B.1.1.3060.003507
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT88B.1.2340.001056
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT88B.1.3610.010309
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT88Q.70.008889
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac77All0.000001
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT77AY.1080.007718
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT77AY.230.000488
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT77AY.7.10.000789
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT77B.1.6210.00062
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc66A.23.10.004225
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66A.23.10.004225
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66AS.10.057143
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66AY.330.000401
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac66AY.440.000037
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66B.1.1.330.002525
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66B.1.1.4330.008547
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66B.1.5820.002944
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66D.20.00045
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66P.1.130.005391
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT66P.60.018868
ORF1ab/nsp3356Y356FtActTc55All0.000001
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac55AY.1030.000031
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55AY.1160.001434
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55AY.130.000805
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc55AY.430.000022
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55AY.610.000524
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55AY.9.20.000184
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---55B.10.000046
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55B.1.1.1530.005476
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55B.1.1460.021186
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55B.1.177.500.023474
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---55B.1.20.000044
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55B.1.3110.001373
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT55B.6.60.004444
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.1100.000451
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.1140.000924
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.1210.000541
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.39.10.000158
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.450.000487
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.70.000784
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac44AY.730.002661
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.90.00027
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44AY.98.10.000194
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.1.10.001307
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.1.2550.012121
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.1.2650.012618
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.1.2690.005413
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.1.3180.001207
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.617.10.000516
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44B.1.6370.000292
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac44P.10.000063
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT44Q.40.001819
ORF1ab/nsp3356Y356ITAcATc230.111111
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA230.111111
ORF1ab/nsp3356Y356ITACATA130.055556
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaG130.055556
ORF1ab/nsp3356Y356del1tAct-c33All0.000001
ORF1ab/nsp3356Y356ITAcATc23All0
ORF1ab/nsp3356Y356ITACATA13All0
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33AY.1130.000427
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33AY.340.000291
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc33AY.40.000005
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---33AY.40.000005
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33AY.46.40.000494
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33AY.700.000626
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33AY.91.10.012195
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.1.1330.025424
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.1.2200.005576
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.177.570.000843
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.177.600.000655
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.177.820.001432
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.3400.012876
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.3660.014634
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.3690.000856
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33B.1.5760.00272
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33C.360.002732
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT33P.1.60.005837
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac220.111111
ORF1ab/nsp3356Y356FtActTc220.111111
ORF1ab/nsp3356Y356RTAcCGc120.055556
ORF1ab/nsp3356Y356HTaCCaT120.055556
ORF1ab/nsp3356Y356RTACCGT120.055556
ORF1ab/nsp3356Y356CtACtGT120.055556
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc120.055556
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac120.055556
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AD.20.000438
ORF1ab/nsp3356Y356RTACCGT12All0
ORF1ab/nsp3356Y356RTAcCGc12All0
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.1060.00067
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac22AY.390.000049
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.420.00008
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac22AY.430.000009
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc22AY.440.000012
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.46.10.002053
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.530.000575
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.620.000871
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.670.000929
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.740.000231
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.840.000875
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22AY.950.001522
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac12B0.000128
ORF1ab/nsp3356Y356HTaCCaT12B0.000128
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac22B.10.000018
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac22B.1.10.000036
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.2430.008163
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.2910.001485
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.4090.005666
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.4160.00181
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1.700.000682
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.1110.00235
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.177.540.001213
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.177.70.00033
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.177.750.002081
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.2390.002442
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac22B.1.2410.001623
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.3440.016393
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.36.290.001035
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.4000.000858
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.5430.02
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---22B.1.5960.000174
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.619.10.001283
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.6200.001892
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc22B.310.007463
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.40.004415
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.400.000729
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22B.60.00182
ORF1ab/nsp3356Y356del1tAct-c22P.10.000032
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22P.1.40.001953
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT22Q.30.00029
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT110.055556
ORF1ab/nsp3356Y356LtACtTA110.055556
ORF1ab/nsp3356Y356KTaCAaA110.055556
ORF1ab/nsp3356Y356FtActTc11A0.000387
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AJ.10.045455
ORF1ab/nsp3356Y356del2tACt--11All0
ORF1ab/nsp3356Y356StActCc11All0
ORF1ab/nsp3356Y356GTAcGGc11All0
ORF1ab/nsp3356Y356KTaCAaA11All0
ORF1ab/nsp3356Y356LtACtTA11All0
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AU.10.001266
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.1070.000466
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11AY.270.000065
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.290.000016
ORF1ab/nsp3356Y356FtActTc11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.4.30.000842
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11AY.430.000004
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.50.000021
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.550.000917
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.750.000056
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.850.000427
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.910.00073
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA11B.10.000009
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac11B.10.000009
ORF1ab/nsp3356Y356GTAcGGc11B.10.000009
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.3050.003861
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.3780.007299
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.4520.111111
ORF1ab/nsp3356Y356FtActTc11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.540.003021
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1.980.018519
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.1570.002985
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.200.001517
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.790.002342
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp3356Y356NTacAac11B.1.258.170.000104
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.2650.001271
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.3430.020833
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.3560.001727
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.36.190.009259
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.36.340.021277
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.36.70.004
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11B.1.3770.004566
ORF1ab/nsp3356Y356del2tACt--11B.1.3910.001127
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.4220.000812
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3356Y356StActCc11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.4800.002488
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp3356Y356XtaCtaA11B.1.4970.000315
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11B.1.5230.002451
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.6180.004032
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11B.3.10.001658
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.4.40.018868
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11B.570.015152
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11C.380.008065
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11C.40.01
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11N.60.007092
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11N.60.007092
ORF1ab/nsp3356Y356delTAC---11P.10.000016
ORF1ab/nsp3356Y356CtActGc11P.10.000016
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp3356Y356del1tAct-c11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp3356Y356HTacCac11Q.30.000145
ORF1ab/nsp3356Y356YtaCtaT11W.40.001351