CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 270

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3270D270ND1088NnonsynGatAat1492149213527-3529
ORF1ab/nsp3270D270DD1088DsyngaTgaC42642613527-3529
ORF1ab/nsp3270D270GD1088GnonsyngAtgGt19119113527-3529
ORF1ab/nsp3270D270delD1088deldelGAT---14514513527-3529
ORF1ab/nsp3270D270YD1088YnonsynGatTat1191180.9915973527-3529
ORF1ab/nsp3270D270YD1088YnonsynGaTTaC11910.008403363527-3529
ORF1ab/nsp3270D270AD1088AnonsyngAtgCt10810813527-3529
ORF1ab/nsp3270D270ED1088EnonsyngaTgaA45280.6222223527-3529
ORF1ab/nsp3270D270ED1088EnonsyngaTgaG45170.3777783527-3529
ORF1ab/nsp3270D270VD1088VnonsyngAtgTt44410.9318183527-3529
ORF1ab/nsp3270D270VD1088VnonsyngATgTC4420.04545453527-3529
ORF1ab/nsp3270D270VD1088VnonsyngATgTG4410.02272733527-3529
ORF1ab/nsp3270D270HD1088HnonsynGatCat6613527-3529
ORF1ab/nsp3270D270del2D1088del2delgATg--650.8333333527-3529
ORF1ab/nsp3270D270del2D1088del2delGAt--t610.1666673527-3529
ORF1ab/nsp3270D270del1D1088del1delgAtg-t520.43527-3529
ORF1ab/nsp3270D270del1D1088del1delgaTga-510.23527-3529
ORF1ab/nsp3270D270del1D1088del1delgATg-N510.23527-3529
ORF1ab/nsp3270D270del1D1088del1delGAT-NN510.23527-3529
ORF1ab/nsp3270D270CD1088CnonsynGAtTGt4413527-3529
ORF1ab/nsp3270D270LD1088LnonsynGAtCTt2213527-3529
ORF1ab/nsp3270D270FD1088FnonsynGAtTTt2213527-3529
ORF1ab/nsp3270D270KD1088KnonsynGaTAaA1113527-3529
ORF1ab/nsp3270D270SD1088SnonsynGAtTCt1113527-3529

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat14921492All0.000285
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat12651265B.1.4090.988281
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC426426All0.000081
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt191191All0.000037
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---145145All0.000028
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat118119All0.000023
ORF1ab/nsp3270D270YGaTTaC1119All0
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt108108All0.000021
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat9494B.1.1.70.000084
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC8787B.1.1.70.000078
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC8585AY.50.001755
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat6970B.1.1.70.000062
ORF1ab/nsp3270D270YGaTTaC170B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt6969B.1.1.70.000062
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC4646AY.250.000277
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC4646AY.40.000072
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA2845All0.000005
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG1745All0.000003
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt4144All0.000008
ORF1ab/nsp3270D270VgATgTC244All0
ORF1ab/nsp3270D270VgATgTG144All0
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat3030B.10.000275
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt2525AY.40.000039
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---2424B.1.1.70.000021
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA2121B.1.1.70.000019
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt2020B.1.5260.00047
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC1919AY.430.000084
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC1919B.1.177.320.025641
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---1919P.1.150.004414
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat1616AY.230.001116
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt1616B.10.000147
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt1616B.1.2580.001065
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC1515AY.680.004106
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt1414AY.1190.000494
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt1414B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---1414P.10.000221
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt1313B.1.177.420.011628
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat1111AY.1030.000068
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---1010B.10.000092
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC1010B.1.20.000088
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---1010B.1.6210.000885
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC99AY.1030.000056
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC99AY.1060.003014
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt99AY.40.000014
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC99B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat99B.1.617.20.000034
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat88AY.430.000035
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat88B.1.177.90.010652
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt77AY.1000.000322
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt77AY.40.000011
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt77AY.440.000043
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat77AY.50.000145
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat77B.1.575.10.017073
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt77B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp3270D270HGatCat66All0.000001
ORF1ab/nsp3270D270del2gATg--56All0.000001
ORF1ab/nsp3270D270del2GAt--t16All0
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt66AY.1030.000037
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt66AY.200.000233
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat66AY.40.000009
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC66AY.520.004886
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp3270D270del1gAtg-t25All0
ORF1ab/nsp3270D270del1gATg-N15All0
ORF1ab/nsp3270D270del1gaTga-15All0
ORF1ab/nsp3270D270del1GAT-NN15All0
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC55B.10.000046
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat55B.1.1.330.002104
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt45B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp3270D270VgATgTC15B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---55C.370.00058
ORF1ab/nsp3270D270CGAtTGt44All0.000001
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG44AY.40.000006
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt44B.10.000037
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG44B.1.1.250.002274
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat44B.1.177.820.001909
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat44B.1.2370.0199
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt44B.1.2430.000278
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat44B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat44P.10.000063
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC33AY.390.000074
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---33AY.430.000013
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC33AY.440.000018
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat33AY.440.000018
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt33AY.46.50.000595
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat33B.10.000027
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat33B.1.1.2220.000612
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC33B.1.5300.021429
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---33B.1.617.20.000011
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22A.2.50.000998
ORF1ab/nsp3270D270FGAtTTt22All0
ORF1ab/nsp3270D270LGAtCTt22All0
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt22AY.1030.000012
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat22AY.140.000176
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat22AY.140.000176
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22AY.250.000012
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22AY.30.00002
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG22AY.30.00002
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22AY.420.00008
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG12AY.440.000006
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA12AY.440.000006
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt22AY.620.000871
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22AY.75.10.000361
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22AY.90.000135
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22AZ.20.001642
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22B.1.1.1740.006757
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22B.1.1.3180.000604
ORF1ab/nsp3270D270del2gATg--22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3270D270HGatCat22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt22B.1.177.370.054054
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22B.1.177.600.000437
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22B.1.2430.000139
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22B.1.258.170.000208
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat22B.1.4200.020833
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22B.1.4290.000047
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat22D.20.00015
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt22N.50.003534
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22N.60.014184
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt22P.1.10.000635
ORF1ab/nsp3270D270del2gATg--22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---22P.1.70.000639
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11A.10.000282
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt11AD.20.000219
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11AE.80.000489
ORF1ab/nsp3270D270SGAtTCt11All0
ORF1ab/nsp3270D270KGaTAaA11All0
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.110.001339
ORF1ab/nsp3270D270SGAtTCt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.120.2.10.000498
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.140.000088
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.240.000431
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3270D270del1GAT-NN11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.250.000006
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.260.000028
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.270.000065
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.290.000016
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.300.000396
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.360.000148
ORF1ab/nsp3270D270HGatCat11AY.40.000002
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11AY.40.000002
ORF1ab/nsp3270D270CGAtTGt11AY.40.000002
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.430.000004
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA11AY.430.000004
ORF1ab/nsp3270D270CGAtTGt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp3270D270HGatCat11AY.440.000006
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.460.000104
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11AY.46.30.000934
ORF1ab/nsp3270D270VgATgTC11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.470.000031
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.530.000288
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11AY.540.000095
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.590.00053
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.640.000595
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp3270D270del2gATg--11AY.670.000464
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11AY.70.000196
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11AY.840.000437
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp3270D270FGAtTTt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3270D270CGAtTGt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11AY.980.000079
ORF1ab/nsp3270D270LGAtCTt11AY.990.001049
ORF1ab/nsp3270D270del1gAtg-t11B.10.000009
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3270D270HGatCat11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.1.2310.003096
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt11B.1.1.2690.001353
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3270D270LGAtCTt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.1.3740.002375
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.1.3750.011905
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.1.3780.007299
ORF1ab/nsp3270D270del1gAtg-t11B.1.1.4330.001425
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3270D270del2GAt--t11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp3270D270AgAtgCt11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp3270D270del1gATg-N11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp3270D270VgAtgTt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.2470.014925
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.3440.008197
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.360.000146
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11B.1.4080.00369
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.4590.004082
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.5040.03125
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.5380.008065
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11B.1.5430.01
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3270D270FGAtTTt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3270D270CGAtTGt11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11B.1.6270.00202
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11C.370.000116
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11C.370.000116
ORF1ab/nsp3270D270NGatAat11C.40.01
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11D.20.000075
ORF1ab/nsp3270D270KGaTAaA11P.10.000016
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11P.10.000016
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11P.10.000016
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaA11P.10.000016
ORF1ab/nsp3270D270HGatCat11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11P.1.100.000269
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp3270D270DgaTgaC11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp3270D270YGatTat11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp3270D270del1gaTga-11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp3270D270EgaTgaG11P.1.17.10.000875
ORF1ab/nsp3270D270VgATgTG11P.1.17.10.000875
ORF1ab/nsp3270D270delGAT---11P.20.000187
ORF1ab/nsp3270D270GgAtgGt11Q.80.000165