CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 207

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3207V207VV1025VsyngtGgtT715769140.9660473338-3340
ORF1ab/nsp3207V207VV1025VsyngtGgtA71571830.02556943338-3340
ORF1ab/nsp3207V207VV1025VsyngtGgtC7157600.00838343338-3340
ORF1ab/nsp3207V207delV1025deldelGTG---1793179313338-3340
ORF1ab/nsp3207V207LV1025LnonsynGtgTtg144114340.9951423338-3340
ORF1ab/nsp3207V207LV1025LnonsynGtgCtg144160.004163783338-3340
ORF1ab/nsp3207V207LV1025LnonsynGtGTtA144110.0006939633338-3340
ORF1ab/nsp3207V207AV1025AnonsyngTggCg1981970.994953338-3340
ORF1ab/nsp3207V207AV1025AnonsyngTGgCT19810.005050513338-3340
ORF1ab/nsp3207V207MV1025MnonsynGtgAtg12912913338-3340
ORF1ab/nsp3207V207GV1025GnonsyngTggGg12100.8333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207GV1025GnonsyngTGgGA1210.08333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207GV1025GnonsyngTGgGT1210.08333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207EV1025EnonsyngTggAg3313338-3340
ORF1ab/nsp3207V207RV1025RnonsynGTgAGg3313338-3340
ORF1ab/nsp3207V207FV1025FnonsynGtGTtC320.6666673338-3340
ORF1ab/nsp3207V207del1V1025del1delgTGgC-310.3333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207del1V1025del1delGtg-tg310.3333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207FV1025FnonsynGtGTtT310.3333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207del1V1025del1delGTG-NN310.3333333338-3340
ORF1ab/nsp3207V207SV1025SnonsynGTGAGT2213338-3340
ORF1ab/nsp3207V207TV1025TnonsynGTGACT210.53338-3340
ORF1ab/nsp3207V207TV1025TnonsynGTgACg210.53338-3340
ORF1ab/nsp3207V207XV1025XnonsynGTGTGA210.53338-3340
ORF1ab/nsp3207V207XV1025XnonsynGTgTAg210.53338-3340
ORF1ab/nsp3207V207IV1025InonsynGtGAtT1113338-3340
ORF1ab/nsp3207V207WV1025WnonsynGTgTGg1113338-3340
ORF1ab/nsp3207V207del2V1025del2delGTg--g1113338-3340

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT69147157All0.001322
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA1837157All0.000035
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC607157All0.000011
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT18541973B.1.1.70.00166
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA1011973B.1.1.70.00009
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC181973B.1.1.70.000016
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---17931793All0.000343
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg14341441All0.000274
ORF1ab/nsp3207V207LGtgCtg61441All0.000001
ORF1ab/nsp3207V207LGtGTtA11441All0
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---847847AY.70.166013
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT596596AY.290.009401
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT573592B.1.617.20.002158
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA12592B.1.617.20.000045
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC7592B.1.617.20.000026
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT381383AY.430.001688
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC2383AY.430.000009
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT305317AY.40.000475
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA8317AY.40.000012
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC4317AY.40.000006
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg302302B.1.1.70.00027
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT246246B.1.4270.012422
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT228233AY.250.001371
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA5233AY.250.00003
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg222222B.1.5270.822222
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---213213B.1.1.70.000191
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT211211AY.270.013656
ORF1ab/nsp3207V207AgTggCg197198All0.000038
ORF1ab/nsp3207V207AgTGgCT1198All0
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT158158AY.1200.005874
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT142142AY.940.06286
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT141141P.20.026316
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg138138B.1.617.20.00052
ORF1ab/nsp3207V207AgTggCg137137B.1.160.181
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT134135AY.30.001333
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC1135AY.30.00001
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg129129All0.000025
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT123123AY.440.000749
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg121122AY.430.000536
ORF1ab/nsp3207V207LGtgCtg1122AY.430.000004
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT108112B.1.3510.00321
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC2112B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA2112B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---109109AY.40.00017
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT100107B.1.20.000881
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA6107B.1.20.000053
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC1107B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT96100B.10.000879
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA2100B.10.000018
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC2100B.10.000018
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT8384AY.1030.000515
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC184AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---7979B.1.20.000696
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg7575AY.40.000117
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---7575B.1.617.20.000282
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT6569P.10.001024
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC469P.10.000063
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg6868B.10.000623
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5959B.1.1770.000777
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5959P.1.140.00282
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5858AY.1020.001538
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5858B.1.2430.004036
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5555B.1.4000.023595
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5252AY.90.003515
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT5252B.1.1600.001622
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT4648B.1.10.000834
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC148B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA148B.1.10.000018
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg4242B.1.1770.000553
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT3939AY.46.50.007738
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT3939B.1.6210.003452
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT3838AY.46.60.002744
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg3333AY.1030.000205
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT3232AY.60.001316
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---3131AY.430.000137
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT3031B.1.2580.001996
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA131B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg3030AY.50.000619
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT2728AY.390.000667
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC128AY.390.000025
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---2828AY.440.00017
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg2324B.1.20.000203
ORF1ab/nsp3207V207LGtgCtg124B.1.20.000009
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT2323B.1.4290.000541
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---2222AY.250.000132
ORF1ab/nsp3207V207AgTggCg2222AY.30.000219
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT2222AY.340.002133
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---2222B.1.1.1980.032305
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1722B.1.617.10.002192
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC522B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT2121AY.260.000595
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT2121AY.50.000434
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT2121B.1.619.10.01347
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg2121B.1.770.954545
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---2020AY.30.000199
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---2020B.1.1.370.003857
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg2020B.1.1.5190.000794
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1420B.1.5260.000329
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA620B.1.5260.000141
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg2020P.10.000315
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg1919AY.440.000116
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1919AY.980.001501
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1818AD.20.003941
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1818AY.34.10.009179
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg1818B.230.052632
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1717AY.110.022758
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1517AY.200.000583
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA217AY.200.000078
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1717B.1.1.390.008665
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg1616AY.1200.000595
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1515AY.1030.000093
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg1515B.1.1.70.000013
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1515C.360.013661
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1414AY.1020.000371
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1113AY.1000.000506
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA213AY.1000.000092
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1313AY.390.000321
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1213AY.9.20.000441
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA113AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1313B.1.1.5190.000516
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1313C.350.010062
ORF1ab/nsp3207V207GgTggGg1012All0.000002
ORF1ab/nsp3207V207GgTGgGA112All0
ORF1ab/nsp3207V207GgTGgGT112All0
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg1212AY.1020.000318
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg1212AY.30.000119
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg1212AY.40.000019
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1212B.1.10.000218
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1212B.1.160.200.107143
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1112P.1.150.002556
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA112P.1.150.000232
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA1011AY.140.00088
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT111AY.140.000088
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1111AY.880.009726
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg1111B.1.10.0002
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg1111B.1.1770.000145
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1010B.1.360.001459
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---1010B.1.4290.000235
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT1010C.370.001161
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT99AY.29.10.001985
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---99AY.460.000937
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg99AY.46.30.008403
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT99AY.9.2.10.017787
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg99AY.980.000711
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---99B.10.000082
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT99B.1.1.2910.006682
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT99B.1.1.3110.003223
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---99B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT99B.1.258.170.000936
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg99B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg88AY.1070.003728
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg88AY.840.0035
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT68AY.99.20.000553
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA28AY.99.20.000184
ORF1ab/nsp3207V207AgTggCg88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg88B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT88B.1.6190.006969
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---88C.370.000929
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT88Q.80.001319
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg77AY.10.00277
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT77AY.130.001127
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT77AY.460.000729
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT77B.1.1.700.002387
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg77B.1.177.40.001477
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---77P.10.00011
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg66AY.200.000233
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg66AY.390.000148
ORF1ab/nsp3207V207AgTggCg66AY.40.000009
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT66AY.4.20.00013
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT56AY.450.000608
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC16AY.450.000122
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg66AY.90.000406
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT56AY.98.10.000242
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC16AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg66B.10.000055
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT66B.1.1.2840.000644
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA66B.1.177.230.019417
ORF1ab/nsp3207V207LGtgTtg66B.1.177.240.007772
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT66B.1.36.80.006
ORF1ab/nsp3207V207delGTG---66B.1.9.50.034091
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtA36D.20.000225
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT26D.20.00015
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtC16D.20.000075
ORF1ab/nsp3207V207MGtgAtg55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp3207V207VgtGgtT55AY.1080.005513
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