CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 196 & Codon = Gtg

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp3196M196VM1014VnonsynAtgGtg3163150.9968353305-3307

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg315316All0.00006
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg6060B.1.1.70.000054
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg3131AY.260.000878
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg3030AY.290.000473
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg2626AY.250.000156
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg2020P.10.000315
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg1313B.1.617.20.000049
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg1111AY.1040.021825
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg1010AY.1200.000372
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg99B.10.000082
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg99B.1.4290.000212
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg88B.1.617.30.023881
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg55Q.80.000825
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg33AY.30.00003
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg33AY.420.000121
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg33AY.440.000018
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg33Q.40.001364
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22AY.340.000194
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22AY.360.000296
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22AY.430.000009
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22AY.750.000112
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg12B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11A.2.50.000499
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11A.50.001923
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.200.000039
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.230.00007
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.450.000122
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.840.000437
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11AY.920.000287
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B0.000128
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.1.3540.004386
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.177.820.000477
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11B.30.000831
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp3196M196VAtgGtg11P.30.001595