CoV-GLUE | Mutations | Mutation
Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):
ORF | CodonNum | Mut | ORF1abMut | MutType | RefCodon | MutCodon | AACount | CodonCount | CodonProp | Genome Position |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | Q1009R | nonsyn | cAa | cGa | 874 | 874 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | Q1009del | del | CAA | --- | 232 | 232 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | Q1009L | nonsyn | cAa | cTa | 158 | 158 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Q1009K | nonsyn | Caa | Aaa | 51 | 51 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | Q1009Q | syn | caA | caG | 25 | 25 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | Q1009P | nonsyn | cAa | cCa | 20 | 20 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Q1009X | nonsyn | Caa | Taa | 16 | 16 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | Q1009H | nonsyn | caA | caT | 4 | 3 | 0.75 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | Q1009H | nonsyn | caA | caC | 4 | 1 | 0.25 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191E | Q1009E | nonsyn | Caa | Gaa | 2 | 2 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191N | Q1009N | nonsyn | CaA | AaC | 2 | 2 | 1 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del1 | Q1009del1 | del | Caa | -aa | 2 | 1 | 0.5 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del1 | Q1009del1 | del | caA | ca- | 2 | 1 | 0.5 | 3290-3292 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del2 | Q1009del2 | del | cAA | c-- | 1 | 1 | 1 | 3290-3292 |
Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):
ORF | CodonNum | Mut | RefCodon | MutCodon | CodonCount | AACount | Lineage | LineageCodonProp |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 874 | 874 | All | 0.000167 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 338 | 338 | B.1.1.7 | 0.000303 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 232 | 232 | All | 0.000044 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 187 | 187 | AY.98.1 | 0.009057 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 158 | 158 | All | 0.00003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 128 | 128 | AY.4.2 | 0.002776 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 96 | 96 | B.1.530 | 0.685714 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 70 | 70 | B.1.1.7 | 0.000063 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 61 | 61 | B.1 | 0.000559 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 51 | 51 | All | 0.00001 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 40 | 40 | B.1.1.519 | 0.001588 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 29 | 29 | C.36.2 | 1 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 25 | 25 | All | 0.000005 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 24 | 24 | AY.4 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 24 | 24 | B.1.1.222 | 0.004896 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 20 | 20 | All | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 17 | 17 | B.1.617.2 | 0.000064 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 16 | 16 | All | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 15 | 15 | AY.44 | 0.000091 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 14 | 14 | B.1.177 | 0.000184 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 13 | 13 | AY.25 | 0.000078 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 10 | 10 | AY.4 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 10 | 10 | B.1.617.2 | 0.000038 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 9 | 9 | B.1.429 | 0.000212 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 7 | 7 | AY.44 | 0.000043 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 7 | 7 | B.1 | 0.000064 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 7 | 7 | B.1.1.7 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 7 | 7 | B.1.2 | 0.000062 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 7 | 7 | B.1.351 | 0.000208 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 6 | 6 | AY.104 | 0.011905 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 6 | 6 | AY.3 | 0.00006 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 6 | 6 | AY.43 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 6 | 6 | B.1.177 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 5 | 5 | AY.103 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 5 | 5 | AY.3 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 5 | 5 | AY.4 | 0.000008 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 5 | 5 | B.1 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 5 | 5 | B.1 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 5 | 5 | B.1.427 | 0.000252 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 5 | 5 | P.1 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | caA | caT | 3 | 4 | All | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | caA | caC | 1 | 4 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 4 | 4 | AY.102 | 0.000106 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 4 | 4 | AY.103 | 0.000025 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 4 | 4 | AY.12 | 0.001264 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 4 | 4 | AY.42 | 0.000161 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 4 | 4 | AY.5 | 0.000083 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 4 | 4 | B.1.1 | 0.000073 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 4 | 4 | B.1.1.519 | 0.000159 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 4 | 4 | B.1.617.2 | 0.000015 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 3 | 3 | AY.100 | 0.000138 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 3 | 3 | AY.102 | 0.00008 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 3 | 3 | AY.121 | 0.000406 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 3 | 3 | AY.25 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 3 | 3 | AY.25 | 0.000018 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 3 | 3 | AY.3 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 3 | 3 | AY.43 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 3 | 3 | AY.54 | 0.000286 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 3 | 3 | B.1.1 | 0.000054 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 3 | 3 | B.1.1.33 | 0.001263 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 3 | 3 | B.1.1.7 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 3 | 3 | B.1.2 | 0.000026 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 3 | 3 | B.1.351 | 0.000089 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 2 | 2 | 0.111111 | |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 2 | 2 | AE.6 | 0.076923 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191E | Caa | Gaa | 2 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191N | CaA | AaC | 2 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del1 | Caa | -aa | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del1 | caA | ca- | 1 | 2 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 2 | 2 | AY.103 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 2 | 2 | AY.29 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 2 | 2 | AY.39 | 0.000049 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 2 | 2 | AY.4 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 2 | 2 | AY.4 | 0.000003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 2 | 2 | AY.44 | 0.000012 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 2 | 2 | B.1.1.348 | 0.001592 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 2 | 2 | B.1.1.388 | 0.090909 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 2 | 2 | B.1.1.519 | 0.000079 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 2 | 2 | B.1.351.2 | 0.000605 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 2 | 2 | B.1.429 | 0.000047 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 2 | 2 | B.1.436 | 0.002058 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 2 | 2 | B.1.525 | 0.000226 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 2 | 2 | B.1.596 | 0.000174 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 2 | 2 | B.1.617.2 | 0.000008 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 2 | 2 | N.6 | 0.014184 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 2 | 2 | P.1 | 0.000032 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 2 | 2 | P.1.15 | 0.000465 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | A | 0.000387 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del2 | cAA | c-- | 1 | 1 | All | 0 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | AY.100 | 0.000046 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | caA | caT | 1 | 1 | AY.102 | 0.000027 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | AY.103 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.108 | 0.001103 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 1 | 1 | AY.117 | 0.000085 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.120 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 1 | 1 | AY.13 | 0.000161 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.14 | 0.000088 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.20 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | AY.20 | 0.000039 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.23 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 1 | 1 | AY.25 | 0.000006 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 1 | 1 | AY.26 | 0.000028 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.29 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.39.1 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 1 | 1 | AY.4 | 0.000002 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 1 | 1 | AY.4.2 | 0.000022 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | AY.41 | 0.000294 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.42 | 0.00004 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | AY.45 | 0.000122 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.46.5 | 0.000198 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | AY.47 | 0.000031 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 1 | 1 | AY.5 | 0.000021 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.5.3 | 0.000337 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | AY.52 | 0.000814 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.61 | 0.000105 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | AY.84 | 0.000437 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.9 | 0.000068 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | AY.9.2 | 0.000037 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | AY.92 | 0.000287 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 1 | 1 | AY.93 | 0.000273 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B | 0.000128 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191E | Caa | Gaa | 1 | 1 | B.1 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.1.10 | 0.001115 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.1.306 | 0.000438 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.1.409 | 0.002833 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.1.416 | 0.000905 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.1.47 | 0.005348 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.1.526 | 0.003546 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del1 | Caa | -aa | 1 | 1 | B.1.1.7 | 0.000001 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.1.70 | 0.000341 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.110.3 | 0.000718 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.128 | 0.000635 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.177 | 0.000013 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.177.11 | 0.001698 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.177.51 | 0.004566 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 1 | 1 | B.1.177.75 | 0.001041 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.177.83 | 0.001481 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del1 | caA | ca- | 1 | 1 | B.1.2 | 0.000009 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.243 | 0.00007 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.260 | 0.003344 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.301 | 0.005917 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191Q | caA | caG | 1 | 1 | B.1.351 | 0.00003 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.36 | 0.000146 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.380 | 0.006623 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.400 | 0.000429 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191P | cAa | cCa | 1 | 1 | B.1.416 | 0.001269 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.427 | 0.00005 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | caA | caT | 1 | 1 | B.1.429 | 0.000024 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.466.2 | 0.000391 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | B.1.523 | 0.002451 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.524 | 0.001406 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.564 | 0.000426 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.595 | 0.000261 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del2 | cAA | c-- | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | B.1.596 | 0.000087 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 1 | 1 | B.1.617.2 | 0.000004 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.1.623 | 0.000536 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191N | CaA | AaC | 1 | 1 | B.29 | 0.003509 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191H | caA | caC | 1 | 1 | B.29 | 0.003509 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.29 | 0.003509 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | B.6 | 0.00091 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | C.17 | 0.055556 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191X | Caa | Taa | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191L | cAa | cTa | 1 | 1 | D.2 | 0.000075 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191K | Caa | Aaa | 1 | 1 | P.1 | 0.000016 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | Q.4 | 0.000455 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191R | cAa | cGa | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | Q.8 | 0.000165 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191N | CaA | AaC | 1 | 1 | R.1 | 0.00009 |
ORF1ab/nsp3 | 191 | Q191del | CAA | --- | 1 | 1 | W.4 | 0.001351 |
CoV-GLUE is still in development. CoV-GLUE was originally developed as part of COG-UK by Josh Singer using the GLUE framework at the MRC-University of Glasgow Centre for Virus Research (CVR). In 2021 it was redeveloped by Richard Orton to scale to the millions of genome sequences available. We acknowledge support from the MRC (MC_UU_12014/12), WT (220977/Z/20/Z) and UKRI G2P (MR/W005611/1). Please contact Richard Orton with any queries: Richard.Orton@glasgow.ac.uk
|