CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1897 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31897V1897IV2715InonsynGttAtt6596530.9908958408-8410

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt653659All0.000125
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt7677B.1.617.20.000286
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt7676B.1.1.2180.584615
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt5555P.20.010265
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt4848B.1.1.70.000043
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt3232B.1.177.40.006754
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt3232P.1.70.010217
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt2929AY.40.000045
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt2828B.1.1.720.848485
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt2323AY.430.000102
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt2020B.1.6370.001461
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1818B.1.36.330.136364
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1414AY.250.000084
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1313B.1.160.290.054852
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1212AY.290.000189
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1112B.1.20.000097
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1111AY.260.000311
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1111AY.30.000109
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt1111B.10.000101
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt99AY.1030.000056
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt99AY.1210.001218
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt66AY.230.000418
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt66B.1.2580.000399
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt44AY.1020.000106
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt44AY.390.000099
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt44AY.460.000416
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt44AY.60.000165
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt44B.1.10.000073
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt44B.1.1.4640.005891
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33AY.1170.000254
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33AY.140.000264
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33AY.920.000862
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33B.1.1.280.000934
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33B.1.3510.000089
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33B.1.930.002801
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt33P.10.000047
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt22AY.200.000078
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt22B.1.258.70.003824
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt22B.1.2980.004228
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt22B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt22P.1.80.009569
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.130.000161
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.420.00004
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.490.003195
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.620.000436
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.80.000606
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11AY.850.000427
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B0.000128
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.1.2220.000204
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.1.480.002874
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.177.740.015152
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11B.1.9.50.005682
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11C.350.000774
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11L.20.011364
ORF1ab/nsp31897V1897IGttAtt11P.1.150.000232