CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1890 & Codon = aaT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31890N1890NN2708NsynaaCaaT6612661218387-8389

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66126612All0.001265
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT13731373B.1.110.30.986351
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT12581258B.1.1.70.001126
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT428428AY.40.000666
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT322322B.10.002949
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT307307B.1.4250.919162
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT248248AY.9.20.009109
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT216216B.1.1100.977376
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT195195AY.430.000864
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT175175B.1.617.20.000659
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT132132P.10.00208
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT112112AY.250.000674
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT111111AY.30.001104
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT9292AY.440.00056
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT8888B.1.20.000775
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT8383AY.1030.000515
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT7373AY.60.003002
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT6767AY.230.004673
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT5555D.20.004127
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT5050B.1.10.000907
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT4444B.1.2210.003125
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT4343B.1.1770.000566
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT4242AY.9.10.003516
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT3535B.1.5960.00305
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2929AY.390.000717
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2929B.1.5260.000682
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2828AY.290.000442
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2727B.1.1.2070.031915
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2626AY.470.000809
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2525B.1.3510.000743
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2222A.20.01456
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2020AY.330.001336
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT2020B.1.5950.005219
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1919B.1.1.5190.000755
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1919B.1.4290.000447
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1717B.1.1.10.005554
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1616AY.1190.000565
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1616AY.1210.002165
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1616AY.750.000896
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1616B.1.2060.013051
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1515AY.200.000583
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1515AY.260.000425
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1515AY.50.00031
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1515B.1.5750.004551
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1414AY.1020.000371
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1414AY.850.00598
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1414B.1.4270.000707
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1414B.1.5250.001584
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1313AY.1170.001099
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1212AY.270.000777
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1212AY.450.00146
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1212AY.7.20.006711
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1212B.1.1.500.008147
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1111AY.420.000443
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1111B.1.6370.000804
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1010AY.1000.00046
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1010AY.610.001048
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1010AY.99.20.000922
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1010B.1.110.11
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1010B.1.177.850.054348
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT1010B.1.351.50.005995
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT99B.1.1110.010576
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT99B.1.258.170.000936
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT99B.1.360.001313
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT99B.1.6210.000797
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT88AY.46.40.001316
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT88B.1.177.330.013158
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT88B.1.177.810.001515
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT88B.1.438.10.000858
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT88R.10.00072
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT77B.1.1.2940.008861
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT77B.1.177.600.001529
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT77B.1.36.180.002941
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT77P.1.100.001886
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66AY.46.10.00616
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66B.1.1.370.001157
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66B.1.110.21
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66B.1.1390.004399
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66B.1.160.260.014528
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66B.1.2340.000792
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT66P.1.17.10.005249
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55AY.1130.000712
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55AY.130.000805
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55AY.340.000485
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55B.1.177.860.000917
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55B.1.2320.002687
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55B.1.36.160.007123
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT55B.1.617.10.000645
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44AY.1100.000451
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44AY.360.000593
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44AY.4.20.000087
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44AY.890.019608
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44AY.980.000316
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B0.000511
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.1.2220.000816
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.1.3060.001754
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.1.630.001543
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.177.510.018265
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.177.730.002265
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.214.20.002398
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44B.1.2400.000862
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT44P.1.140.000191
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33A.2.50.001497
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.1180.000188
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.34.10.00153
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.39.10.000119
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.5.20.007389
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.540.000286
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.570.001969
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.690.00056
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.70.000588
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33B.1.1.2180.023077
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33B.1.1.3720.002066
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33B.1.1.710.018182
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT33P.1.70.000958
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT220.111111
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22A0.000774
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22A.280.005291
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.140.000176
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.550.001835
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.700.000417
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AY.90.000135
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22AZ.10.001735
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.1.2140.000111
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.1.2310.006192
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.177.770.001452
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.3620.003082
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.3750.001639
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.5610.000794
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.621.10.001012
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.6230.001073
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.6270.00404
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22C.140.008658
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22C.370.000232
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22N.30.011628
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22P.30.00319
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11A.2.20.001689
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11A.2.5.20.001572
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11A.240.071429
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11A.270.001656
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AT.10.005128
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.1060.000335
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.120.000316
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.160.00038
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.320.000532
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.670.000464
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.710.000475
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.810.001992
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.840.000437
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.920.000287
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11AY.950.000761
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.1010.01
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.1800.010753
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.2750.011236
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.2770.000759
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.2980.000862
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.3530.020833
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.5070.008696
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1.990.02381
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.1470.000756
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.177.840.006667
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.258.220.002667
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.3140.007519
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.36.310.001751
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.3890.001002
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.4160.001269
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.428.20.033333
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.4430.004673
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.4990.00105
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5170.000427
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.564.10.001577
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5790.011236
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5820.000491
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5870.001898
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.5990.00365
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.6090.000479
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.1.6120.002653
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11B.40.002208
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11C.20.016129
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11C.350.000774
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11C.360.000911
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11N.50.001767
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11P.20.000187
ORF1ab/nsp31890N1890NaaCaaT11Q.10.000126