CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1890 & Codon = ---

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31890N1890delN2708deldelAAC---17617618387-8389

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---176176All0.000034
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---5656B.1.1.70.00005
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---1111B.10.000101
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---99B.1.1770.000119
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---66AY.40.000009
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---440.222222
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---44AY.430.000018
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---44B.1.20.000035
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---44C.370.000464
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---44P.10.000063
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---33AY.250.000018
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---33P.1.150.000697
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22AD.20.000438
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22AZ.20.001642
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22B.1.1.2360.013793
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22B.1.177.630.005405
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22B.1.2340.000264
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---22B.1.36.170.000988
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.200.000039
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.460.000104
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.610.000105
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.720.001361
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.810.001992
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11C.170.055556
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31890N1890delAAC---11U.30.003861