CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1875

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31875D1875DD2693DsyngaCgaT4739473918342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875delD2693deldelGAC---17617618342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875YD2693YnonsynGacTac88850.9659098342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875YD2693YnonsynGaCTaT8830.03409098342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875ND2693NnonsynGacAac454518342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875GD2693GnonsyngAcgGc26210.8076928342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875GD2693GnonsyngACgGG2640.1538468342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875GD2693GnonsyngACgGA2610.03846158342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875VD2693VnonsyngAcgTc20190.958342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875VD2693VnonsyngACgTT2010.058342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875AD2693AnonsyngAcgCc19180.9473688342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875HD2693HnonsynGacCac19140.7368428342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875HD2693HnonsynGaCCaT1950.2631588342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875AD2693AnonsyngACgCG1910.05263168342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875ED2693EnonsyngaCgaG1790.5294128342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875ED2693EnonsyngaCgaA1780.4705888342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875RD2693RnonsynGACAGG1480.5714298342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875RD2693RnonsynGACCGG1430.2142868342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875RD2693RnonsynGAcCGc1430.2142868342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del2D2693del2delgACg--1290.758342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del2D2693del2delGACA--1220.1666678342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del2D2693del2delGAc--c1210.08333338342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del1D2693del1delGac-ac950.5555568342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del1D2693del1delgAcg-c910.1111118342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del1D2693del1delgACg-T910.1111118342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del1D2693del1delGAC-NN910.1111118342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875del1D2693del1delgACg-N910.1111118342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875KD2693KnonsynGaCAaA760.8571438342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875KD2693KnonsynGaCAaG710.1428578342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875QD2693QnonsynGaCCaG3318342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875FD2693FnonsynGAcTTc2218342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875TD2693TnonsynGAcACc1118342-8344
ORF1ab/nsp31875D1875SD2693SnonsynGAcAGc1118342-8344

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT47394739All0.000906
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11451145B.1.1.70.001025
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT239239AY.40.000372
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT194194B.1.3510.005767
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---176176All0.000034
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT175175B.1.1770.002304
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT160160B.1.20.001409
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT150150P.10.002363
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT148148B.1.617.20.000557
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT127127B.10.001163
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT123123AY.39.10.004872
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT117117AY.250.000704
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT112112AY.1030.000695
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT110110AY.440.00067
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT109109AY.46.40.017931
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT104104AY.200.004042
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT9090AY.430.000399
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac8588All0.000016
ORF1ab/nsp31875D1875YGaCTaT388All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT8585B.1.5430.85
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT6767B.1.2210.004759
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT6666AY.30.000656
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5858AY.1020.001538
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5757AE.80.027873
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---5656B.1.1.70.00005
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5353B.1.1.5190.002105
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5151AY.390.00126
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT5151AY.850.021786
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac4545All0.000009
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4545B.1.177.820.02148
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4343AY.750.002409
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4242B.1.10.000762
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4141B.1.6090.019655
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT4040AD.20.008758
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3434AY.1060.011386
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3333AY.260.000934
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3131AY.610.003248
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT3030B.1.1600.000936
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2929AY.340.002812
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2828B.1.5260.000658
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac2727B.1.1.70.000024
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc2126All0.000004
ORF1ab/nsp31875D1875GgACgGG426All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875GgACgGA126All0
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2323B.1.4290.000541
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2222AY.1000.001012
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT2121P.1.140.001004
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc1920All0.000004
ORF1ab/nsp31875D1875VgACgTT120All0
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc1819All0.000003
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac1419All0.000003
ORF1ab/nsp31875D1875HGaCCaT519All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875AgACgCG119All0
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1919AY.4.50.002042
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1818AY.1200.000669
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1818AY.420.000724
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1818B.1.1.2220.003672
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG917All0.000002
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaA817All0.000002
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1717AY.230.001186
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1717B.1.1.2400.079812
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1616AY.790.01937
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1616AY.840.006999
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1515B.1.4270.000757
ORF1ab/nsp31875D1875RGACAGG814All0.000002
ORF1ab/nsp31875D1875RGAcCGc314All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875RGACCGG314All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1313AY.50.000268
ORF1ab/nsp31875D1875del2gACg--912All0.000002
ORF1ab/nsp31875D1875del2GACA--212All0
ORF1ab/nsp31875D1875del2GAc--c112All0
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1212AY.140.001056
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1212AY.4.20.00026
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1212B.1.1.3680.037037
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1111AY.1170.00093
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1111AY.1190.000388
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1111AY.480.005116
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---1010B.10.000092
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010B.1.1.500.006789
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010B.1.360.001459
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010B.1.6370.000731
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010C.370.001161
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT1010P.20.001866
ORF1ab/nsp31875D1875del1Gac-ac59All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875del1gAcg-c19All0
ORF1ab/nsp31875D1875del1gACg-T19All0
ORF1ab/nsp31875D1875del1gACg-N19All0
ORF1ab/nsp31875D1875del1GAC-NN19All0
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---99AY.250.000054
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac99AZ.20.007389
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac99B.10.000082
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT99B.1.351.10.346154
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT99P.1.70.002874
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT88AY.270.000518
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT88AY.5.40.002214
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac88B.1.1.70.000007
ORF1ab/nsp31875D1875KGaCAaA67All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875KGaCAaG17All0
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77AY.330.000467
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc77B.1.1770.000092
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77B.1.2430.000487
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77B.1.258.170.000728
ORF1ab/nsp31875D1875GgACgGG37P.10.000047
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc37P.10.000047
ORF1ab/nsp31875D1875GgACgGA17P.10.000016
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT77R.10.00063
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.290.000095
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.540.000572
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.60.000247
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.90.000406
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66AY.980.000474
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac66B.10.000055
ORF1ab/nsp31875D1875del2gACg--56B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp31875D1875del2GAc--c16B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31875D1875KGaCAaA66B.1.20.000053
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66B.1.6210.000531
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT66D.20.00045
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---55AY.4.50.000537
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---55AY.430.000022
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.450.000608
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.46.60.000361
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.710.002375
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.880.004421
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.910.003652
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55AY.99.20.000461
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---55B.1.10.000091
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.1.2160.004452
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaA45B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG15B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.5030.012438
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT55B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac45B.1.617.20.000015
ORF1ab/nsp31875D1875YGaCTaT15B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---55P.10.000079
ORF1ab/nsp31875D1875RGACAGG440.222222
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44AY.1130.00057
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44AY.3.10.000341
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---44AY.40.000006
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc44AY.430.000018
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44AY.950.003044
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B0.000511
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.1.2690.005413
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.1.280.001245
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac44B.1.1.390.002039
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.1.630.001543
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac44B.1.1.70.000004
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.177.430.005908
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.2340.000528
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.2580.000266
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.1.36.170.001976
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44B.60.00364
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---44C.370.000464
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac34D.20.000225
ORF1ab/nsp31875D1875YGaCTaT14D.20.000075
ORF1ab/nsp31875D1875RGAcCGc24P.10.000032
ORF1ab/nsp31875D1875RGACCGG24P.10.000032
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---44P.1.150.000929
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT44Q.10.000505
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33A0.001161
ORF1ab/nsp31875D1875QGaCCaG33All0.000001
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc33AY.1000.000138
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.1140.000693
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.116.10.000934
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.320.001597
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.360.000445
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac33AY.40.000005
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.5.30.001012
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.70.000588
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac33B.1.10.000054
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.1.2980.002586
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.1.4160.002715
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.1.540.009063
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.177.100.002634
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.177.210.000229
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.177.50.003727
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---33B.1.20.000026
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.351.20.000908
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.5240.004219
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT33B.1.5560.022556
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG33P.10.000047
ORF1ab/nsp31875D1875del2GACA--220.111111
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---220.111111
ORF1ab/nsp31875D1875FGAcTTc22All0
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.10.000791
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1040.003968
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1080.002205
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.120.000632
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.130.000322
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.16.10.00094
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac22AY.230.000139
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac22AY.23.10.000835
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.240.000862
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc22AY.30.00002
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac12AY.430.000004
ORF1ab/nsp31875D1875YGaCTaT12AY.430.000004
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.470.000062
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22AY.50.000041
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.640.00119
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22AY.7.20.001119
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc22B.10.000018
ORF1ab/nsp31875D1875del1gAcg-c12B.10.000009
ORF1ab/nsp31875D1875AgACgCG12B.10.000009
ORF1ab/nsp31875D1875del1gACg-T12B.10.000009
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc12B.10.000009
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac22B.1.1.1610.007067
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22B.1.1.2360.013793
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.2430.008163
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.2550.006061
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.2790.002242
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22B.1.1.3110.000716
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac22B.1.1.390.001019
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.4320.002532
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc22B.1.1.460.008734
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG22B.1.1.5190.000079
ORF1ab/nsp31875D1875RGACAGG22B.1.1.70.000002
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac22B.1.1570.00597
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.160.70.004158
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac22B.1.1770.000026
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.177.790.004684
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22B.1.177.870.001456
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.221.10.005814
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.36.80.002
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.5750.000607
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.6280.000705
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22B.1.930.001867
ORF1ab/nsp31875D1875HGaCCaT22C.160.002121
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac22P.10.000032
ORF1ab/nsp31875D1875QGaCCaG22P.10.000032
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp31875D1875GgACgGG12P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875RGAcCGc12P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc12P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875RGACCGG12P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT22Q.80.00033
ORF1ab/nsp31875D1875del1Gac-ac11A0.000387
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11A0.000387
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11A.20.000662
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11A.280.002646
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AL.10.012987
ORF1ab/nsp31875D1875SGAcAGc11All0
ORF1ab/nsp31875D1875TGAcACc11All0
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.1010.00049
ORF1ab/nsp31875D1875HGaCCaT11AY.1020.000027
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.1080.001103
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp31875D1875HGaCCaT11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11AY.1190.000035
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11AY.120.000316
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.120.10.000321
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.190.00114
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.190.00114
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.200.000039
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11AY.230.00007
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11AY.230.00007
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11AY.250.000006
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaA11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.34.10.00051
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc11AY.40.000002
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11AY.40.000002
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp31875D1875del1Gac-ac11AY.430.000004
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11AY.430.000004
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11AY.430.000004
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11AY.440.000006
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11AY.460.000104
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31875D1875TGAcACc11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.520.000814
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.580.000907
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31875D1875del2gACg--11AY.610.000105
ORF1ab/nsp31875D1875del1Gac-ac11AY.660.00107
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.670.000464
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.680.000274
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.810.001992
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.840.000437
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.860.00083
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.90.000068
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11AY.930.000273
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AY.990.001049
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp31875D1875del2gACg--11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B0.000128
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc11B0.000128
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11B0.000128
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B0.000128
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11B.10.000009
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaA11B.10.000009
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31875D1875FGAcTTc11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31875D1875RGACAGG11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.1.1590.004673
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.1.1890.001513
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2190.005
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2290.005747
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2360.006897
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.250.000569
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2580.003257
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.1.2790.001121
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3020.002075
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3160.000925
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3180.000302
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3350.012987
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc11B.1.1.4110.014706
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.4200.001006
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.5070.008696
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp31875D1875FGAcTTc11B.1.1.5230.001563
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1.5260.003546
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31875D1875del1gACg-N11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31875D1875SGAcAGc11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31875D1875RGACAGG11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1260.001276
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.1580.02381
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.160.140.002119
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.160.150.00495
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.160.160.000929
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.160.300.002976
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.160.80.001289
ORF1ab/nsp31875D1875del2gACg--11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.100.000878
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.170.000821
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11B.1.177.190.001431
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.350.000691
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.410.0025
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.50.001242
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.510.004566
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.177.530.002392
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.730.000566
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.1780.02381
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.1790.003759
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.214.30.007143
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2180.005155
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.2360.002053
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2540.025
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31875D1875del2gACg--11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.258.30.001675
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.2790.000514
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.2930.0125
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3200.001245
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3260.007576
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3400.004292
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31875D1875del1Gac-ac11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4040.001302
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4060.006061
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4240.008065
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4250.002994
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4360.001029
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4520.013699
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4560.003268
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4670.04
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4680.005714
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.4710.002732
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.5250.000113
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.5390.017544
ORF1ab/nsp31875D1875NGacAac11B.1.5650.00081
ORF1ab/nsp31875D1875VgAcgTc11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaA11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31875D1875del1Gac-ac11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31875D1875HGaCCaT11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31875D1875KGaCAaG11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.1.6310.003367
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.30.000831
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11B.310.003731
ORF1ab/nsp31875D1875AgAcgCc11B.400.000364
ORF1ab/nsp31875D1875GgAcgGc11B.550.00295
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.160.00106
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11C.170.055556
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.180.002591
ORF1ab/nsp31875D1875VgACgTT11C.350.000774
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.37.10.002618
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11C.390.018868
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaA11D.20.000075
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11D.20.000075
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11N.90.005952
ORF1ab/nsp31875D1875del1GAC-NN11P.10.000016
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31875D1875YGacTac11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp31875D1875EgaCgaG11P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875HGacCac11P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875QGaCCaG11P.20.000187
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31875D1875delGAC---11Q.20.000613
ORF1ab/nsp31875D1875DgaCgaT11Q.30.000145