CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1857 & Codon = ctT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31857L1857LL2675LsynctCctT723869710.9631118288-8290

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT69717238All0.001333
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT21332143B.1.1.70.00191
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT657659B.1.617.20.002474
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT319323AY.40.000496
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT226226AY.1030.001403
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT208209AY.440.001266
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT184188AY.430.000815
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT180180P.10.002836
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22174B.1.177.860.004036
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT168168AY.120.2.10.083707
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT158158B.1.2210.011223
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT142144B.1.20.00125
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT104141AY.250.000626
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT116121B.10.001063
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT117117AY.200.004547
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT9293B.1.10.001669
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT8490B.1.1770.001106
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT8989B.1.5230.218137
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT8686AY.540.0082
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT7281B.1.4290.001694
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT6969AY.290.001088
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT6767B.1.177.620.079857
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT6262AY.750.003473
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT5959B.1.1600.00184
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT5656AY.1020.001485
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT5353AY.30.000527
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT5050AY.260.001416
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT4949AY.1170.004141
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT4747B.1.5260.001105
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT4444AY.990.04617
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT4343AY.710.020428
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT3940AY.390.000964
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT4040B.1.258.170.004159
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT3138AY.4.20.000672
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT3737B.1.3510.0011
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2929B.1.2580.00193
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2929B.1.5250.003282
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2828AY.680.007665
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2828B.1.4270.001414
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2525AY.99.20.002304
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2525B.1.1.3550.384615
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2324AY.1190.000812
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2222AY.1000.001012
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2222AY.46.60.001589
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2222B.1.1.3170.009057
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT2020AY.1180.001253
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1919AY.50.000392
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1919AY.60.000781
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1718AY.330.001135
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1717AY.23.10.007095
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1215B.1.1.5190.000477
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1414AY.4.10.010324
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1414B.1.220.018445
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1414B.1.4740.026616
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1313AY.1060.004354
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1212AY.460.001249
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1212B.1.5311
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1212C.370.001393
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1212P.1.140.000574
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1111AY.320.005857
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1111B.1.1.4160.009955
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1010AY.240.00431
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT1010AY.470.000311
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT99A.290.047872
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT99AY.1010.004414
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT99AY.4.50.000967
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT69AY.420.000241
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT79AY.450.000852
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT99AY.90.000608
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT89B.1.2430.000557
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT88AY.370.002528
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT88AY.46.40.001316
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT88AY.70.001568
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT88AY.850.003417
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT88P.1.150.001859
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77AY.1130.000997
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77AY.3.10.000597
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77AY.340.000679
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77AY.39.10.000277
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77AY.980.000553
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77B.1.1.250.00398
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77B.1.1.2980.006034
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77B.1.360.001021
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77B.1.5750.002124
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77P.1.170.001132
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77P.20.001306
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT77R.10.00063
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66AY.360.000889
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66AY.610.000629
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66AY.75.10.001082
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66B.1.1.2220.001224
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66B.1.36.290.003104
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT66D.20.00045
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55AY.160.001898
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55AY.5.40.001384
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55AY.900.003422
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55AY.920.001436
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55B.1.1.2140.000277
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55B.1.1.280.001556
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55B.1.1.2840.000537
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55B.1.1.2910.003712
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55B.1.466.20.001956
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55B.40.011038
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55C.180.012953
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55Q.80.000825
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT55W.40.006757
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44AY.1080.00441
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44AY.1200.000149
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44AY.130.000644
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44AY.16.10.00188
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT34AY.230.000209
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44AY.34.10.00204
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44AY.580.00363
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44B.1.177.50.004969
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44B.1.177.70.000659
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44B.1.177.740.060606
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44B.1.351.30.003506
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44B.1.5170.001708
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT44B.1.5960.000349
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33AY.1040.005952
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT23AY.1210.000271
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33AY.300.001187
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33AY.670.001393
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33AY.740.000347
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT23B0.000256
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.1.1210.007282
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.1.1920.006928
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.1.3510.00838
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.130.007126
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.177.120.000455
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.177.160.001993
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.1790.011278
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.2410.002435
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT23B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.36.310.005254
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.4080.01107
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.5680.003333
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT23B.1.5950.000522
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT33P.1.160.001122
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AE.80.000978
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.100.00106
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.1110.000366
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.4.2.10.000298
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.4.40.000818
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.400.001929
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT12AY.520.000814
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT12AY.650.000533
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22AY.99.10.003106
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.1.1860.006873
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.1.2160.001781
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.1.2940.002532
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.1.3480.001592
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.1.3740.004751
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.1.440.004819
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.177.210.000153
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.177.690.002967
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.177.770.001452
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.177.810.000379
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.36.220.002415
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.3670.001585
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.4220.001625
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.4990.002101
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.5300.014286
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22B.1.6320.013423
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22C.350.001548
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT22Q.10.000253
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11A.2.5.30.010309
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AV.10.005051
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.110.001339
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.140.000088
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.220.002092
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.380.000499
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.46.50.000198
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.510.000909
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.550.000917
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.620.000436
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.690.000187
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.7.10.000113
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.700.000209
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.770.001127
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.840.000437
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.870.000833
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.880.000884
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.9.10.000084
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11AY.960.002075
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.1150.008929
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.1170.009709
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.1530.001095
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.1640.005155
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.1760.000439
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.2180.007692
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.2200.001859
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.2280.003049
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.2890.002083
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.30.008696
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.3010.001179
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.3620.005618
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.3770.001381
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.4320.001266
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.4480.002033
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.4640.001473
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.5000.02
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.560.017857
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.630.000386
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1.80.003584
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.110.30.000718
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1110.001175
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.1310.008772
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.160.110.005714
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.160.260.002421
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.177.520.001757
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.177.550.002331
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.177.600.000218
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.177.80.000752
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.177.830.001481
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.177.850.005435
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.2140.003663
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.214.20.0006
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.2390.001221
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.2420.018868
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.258.220.002667
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.2980.002114
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3330.010526
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3350.010309
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3400.004292
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3490.000715
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.351.20.000303
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3700.008
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3750.00082
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3810.007812
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.3990.001934
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.4000.000429
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.438.10.000107
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.4800.002488
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.4920.007042
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.5030.002488
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.5880.00091
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.6190.000871
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11B.1.6280.000352
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11C.10.002392
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11C.20.016129
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11C.300.001727
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11N.50.001767
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11P.1.10.000318
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11P.1.40.000977
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11P.30.001595
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11P.60.003145
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11Q.30.000145
ORF1ab/nsp31857L1857LctCctT11Q.70.001111