CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1635 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31635V1635IV2453InonsynGttAtt1581570.9936717622-7624

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt157158All0.00003
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt5757AY.1190.002013
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt1818AY.430.00008
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt1313B.1.20.000114
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt1212AY.250.000072
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt77B.1.1.70.000006
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt55AY.440.00003
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt44AY.40.000006
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt44B.1.1770.000053
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt44B.1.5250.000453
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt33B.1.2400.000647
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt120.055556
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt22AY.1020.000053
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt22AY.5.40.000553
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt22B.10.000018
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.1030.000006
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.1100.000113
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.230.00007
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.470.000031
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.610.000105
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.670.000464
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11B.1.1.5190.00004
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11B.1.3980.002976
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11C.36.30.000567
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11D.20.000075
ORF1ab/nsp31635V1635IGttAtt11P.10.000016