CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1444 & Codon = taT

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31444Y1444YY2262YsyntaCtaT99699617049-7051

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT996996All0.00019
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT122122B.1.1.4060.792208
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT106106B.1.1.70.000095
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT5454B.1.1600.001684
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT4949AY.250.000295
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT4848B.1.617.20.000181
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT4545AY.40.00007
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT4343AY.1190.001518
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT3636AY.430.000159
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT3434C.350.026316
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT3333C.370.00383
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT3131B.1.1770.000408
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT2424B.10.00022
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT2323B.1.20.000203
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT2222AY.440.000134
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT2222B.1.3690.006275
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT2121B.1.4170.6
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT1616AY.1030.000099
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT1313AY.130.002093
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT1313B.1.4990.013655
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT1111B.1.2180.056701
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT1111B.1.6390.23913
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT1111P.10.000173
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT88AY.390.000198
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT88AY.610.000838
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT77B.1.4290.000165
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT66B.1.1.2320.010889
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55AY.1000.00023
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55AY.1020.000133
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55AY.116.10.001557
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55AY.4.20.000108
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55B.1.2400.001078
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55B.1.2430.000348
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55B.1.4270.000252
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT44AY.1180.000251
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT44AY.16.10.00188
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT44AY.420.000161
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT44AY.5.30.00135
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT44B.1.5250.000453
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT33AY.200.000117
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT33AY.410.000882
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT33AY.90.000203
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT33B.1.1.2340.036145
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.1010.000981
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.270.000129
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.34.10.00102
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.450.000243
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.470.000062
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.770.002255
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22AY.98.10.000097
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.1.1170.019417
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.1.2220.000408
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.1.3120.003824
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.2360.004107
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.617.10.000258
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22B.1.6370.000146
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT22D.20.00015
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT110.055556
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11A.220.066667
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AD.20.000219
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AE.10.011364
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.260.000028
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.280.00189
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.290.000016
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.340.000097
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.350.000233
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.640.000595
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.2140.000055
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.2160.00089
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.370.000193
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.4040.015873
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.4340.000349
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.480.002874
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1490.003425
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.1690.014925
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.390.015385
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.630.002703
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.650.000665
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.177.860.000183
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.2320.000537
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.3240.001605
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.351.50.0006
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.36.70.004
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.3770.004566
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.4700.001404
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.5260.000024
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.5870.001898
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11P.1.120.000484
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11P.1.130.000898
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11P.1.160.000374
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11P.1.170.000162
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11P.1.70.000319
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31444Y1444YtaCtaT11Q.80.000165