CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1417 & Codon = Tta

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31417L1417LL2235LsynCtaTta16634165190.9930866968-6970

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1651916634All0.003159
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1198912002B.1.1.70.010733
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta10921093AY.1030.00678
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta399417AY.40.000621
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta252254B.1.617.20.000949
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta252252AY.4.2.10.037545
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta230232AY.430.001019
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta160161B.1.2210.011365
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta138154AY.30.001373
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta131131AY.880.115827
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta102104B.1.10.00185
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta101101B.1.3510.003002
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta8989B.1.20.000784
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta8086AY.250.000481
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta8585AY.4.20.001844
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta8384B.1.1770.001093
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta7778P.10.001213
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta6464B.1.1.3290.246154
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta5656B.1.1.1980.082232
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta4353AY.440.000262
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta5252AY.116.10.016194
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta4242AY.750.002353
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta4242B.10.000385
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta4040B.1.36.340.851064
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta3840B.1.4290.000894
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta3333AY.1190.001165
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta3333B.1.177.70.00544
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta3030AY.670.013928
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta3030B.1.4270.001515
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2929B.1.2580.00193
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2525AY.420.001006
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2124AY.1020.000557
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1124AY.200.000428
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2323AY.290.000363
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2123AY.390.000519
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2323B.1.1.2140.001276
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2122AY.50.000434
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta2020B.1.5260.00047
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1919B.1.5740.04086
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1818AY.99.20.001659
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1616AY.470.000498
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1515AY.330.001002
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1414B.1.1.1640.072165
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1313Q.10.001642
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1212AY.1000.000552
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1111B.1.1.2860.031884
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1111B.1.1600.000343
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1111D.20.000825
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1011R.10.0009
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1010AY.230.000697
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta910AY.540.000858
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta1010P.1.140.000478
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta99B.1.1.5190.000357
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta99B.1.177.830.013333
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta99B.1.5750.002731
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta67AY.1200.000223
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta77B.1.1.2220.001428
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta77B.1.1.3170.002882
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta77B.1.5880.006369
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta77Q.80.001154
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66A.23.10.004225
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66AY.1100.000676
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66AY.140.000528
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66AY.610.000629
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66B.1.177.350.004147
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66B.1.258.170.000624
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66B.1.4990.006303
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta56B.1.5960.000436
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66B.1.6370.000438
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta66P.1.70.001916
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta55AY.260.000142
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta55AY.60.000206
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta55AY.840.002187
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta55B.1.1.3220.04386
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta55B.1.177.600.001092
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta55B.1.6210.000443
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta44AY.450.000487
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta44B.1.1.3480.003185
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta34B.1.2340.000396
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta44C.370.000464
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta44P.1.150.000929
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33AY.1160.00086
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33AY.1180.000188
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33AY.190.003421
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta13AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33AY.480.001395
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.1.4090.008499
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.177.30.022901
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.177.420.002683
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.1990.012397
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.2100.006397
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.3460.003932
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.360.000438
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.4060.018182
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.617.10.000387
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.1.6280.001057
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33B.6.60.002667
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta33P.20.00056
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta12A.2.40.003367
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22A.210.00554
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.100.00106
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.1170.000169
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.120.000632
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.120.10.000642
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.1210.000271
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.130.000322
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.29.10.000441
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.320.001065
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.340.000194
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.460.000208
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.46.40.000329
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.46.50.000397
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.850.000854
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.1530.002191
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.1710.007353
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.1860.006873
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.2320.00363
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.330.000842
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1.4340.000697
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta12B.1.1.500.000679
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1470.001512
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.177.730.001133
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.1790.007519
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.2410.001623
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.3560.003454
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.466.20.000782
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.4680.011429
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.5250.000226
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22N.50.003534
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22N.60.014184
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22P.1.120.000968
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta22Q.30.00029
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11A.10.000282
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.1050.000643
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.1110.000183
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.1130.000142
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.1140.000231
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.120.20.001285
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.270.000065
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.380.000499
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.39.20.001541
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.410.000294
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.490.003195
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.530.000288
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.550.000917
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.570.000656
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.690.000187
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.70.000196
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.710.000475
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.80.000606
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.870.000833
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.920.000287
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AY.990.001049
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11AZ.20.000821
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B0.000128
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.10.000327
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.1170.009709
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.1410.002012
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.1570.000913
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.1700.001247
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.2730.006757
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.280.000311
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.3040.002809
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.3890.006061
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.3980.003226
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.4120.007634
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.4160.000905
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.510.001718
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.5250.005464
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.177.120.000152
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.177.880.012346
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.2030.0625
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.2060.000816
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.2430.00007
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.36.160.001425
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.36.70.004
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.3610.001289
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.3620.001541
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.3690.000285
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.3960.000706
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.4280.00102
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.438.20.019231
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.4530.003236
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.4690.00361
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.5090.000866
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.5510.00129
ORF1ab/nsp31417L1417LCtaTta11B.1.5610.000397
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