CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1389 & Codon = Agt

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31389G1389SG2207SnonsynGgtAgt156515630.9987226884-6886

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt15631565All0.000299
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt511511AY.40.000795
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt202203B.1.2410.163961
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt131131N.50.231449
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt129129B.1.1.70.000115
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt9090B.1.617.20.000339
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt3838AY.250.000229
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt3434B.10.000311
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2727AY.430.00012
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2424B.1.10.000435
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2020AY.30.000199
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2020B.1.3510.000595
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1919AY.1030.000118
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1818AY.440.00011
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1717AY.1020.000451
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1616B.1.20.000141
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1212AY.390.000297
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1111B.1.4290.000259
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt88AY.290.000126
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt88B.1.4270.000404
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt88B.1.4990.008403
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.200.000272
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.410.002058
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.460.000729
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.46.60.000505
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt67AY.590.003178
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.99.20.000645
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66AY.540.000572
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66R.10.00054
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55AY.1200.000186
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55AY.230.000349
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55P.10.000079
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.260.000113
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.420.000161
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.470.000124
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.780.006163
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44C.350.003096
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.50.000062
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.680.000821
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.960.006224
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.120.2.10.000997
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.610.00021
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.630.000774
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.930.000546
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22C.10.004785
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22C.370.000232
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11A0.000387
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11A.270.001656
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.1150.005208
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.350.000233
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.510.000909
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.560.001605
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B0.000128
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.2540.011236
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.710.006061
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.710.010101
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.60.00091
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11C.120.007194
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11C.360.000911
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11P.1.10.10.00813
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11Q.40.000455
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11R.20.014493