CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1389

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31389G1389SG2207SnonsynGgtAgt156515630.9987226884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389SG2207SnonsynGgTAgC156520.001277966884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389CG2207CnonsynGgtTgt7607570.9960536884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389CG2207CnonsynGgTTgC76030.003947376884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389GG2207GsynggTggC5735300.9249566884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389GG2207GsynggTggG573290.05061086884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389GG2207GsynggTggA573140.02443286884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389VG2207VnonsyngGtgTt2442420.9918036884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389VG2207VnonsyngGTgTG24410.004098366884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389VG2207VnonsyngGTgTA24410.004098366884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389delG2207deldelGGT---24324316884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389DG2207DnonsyngGtgAt16150.93756884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389DG2207DnonsyngGTgAC1610.06256884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389del1G2207del1delggTgg-830.3756884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389del1G2207del1delGgt-gt820.256884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389del1G2207del1delGGT-NN810.1256884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389del1G2207del1delGgT-gN810.1256884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389del1G2207del1delgGTgA-810.1256884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389AG2207AnonsyngGtgCt5516884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389RG2207RnonsynGgTAgA310.3333336884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389RG2207RnonsynGgTAgG310.3333336884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389RG2207RnonsynGgtCgt310.3333336884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389YG2207YnonsynGGtTAt2216884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389IG2207InonsynGGtATt2216884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389del2G2207del2delgGTg--2216884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389NG2207NnonsynGGtAAt2216884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389MG2207MnonsynGGTATG1116884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389KG2207KnonsynGGTAAA1116884-6886
ORF1ab/nsp31389G1389TG2207TnonsynGGTACA1116884-6886

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt15631565All0.000299
ORF1ab/nsp31389G1389SGgTAgC21565All0
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt757760All0.000145
ORF1ab/nsp31389G1389CGgTTgC3760All0.000001
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC530573All0.000101
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG29573All0.000006
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA14573All0.000003
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt511511AY.40.000795
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt367367B.1.1.70.000329
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC360360AY.250.002165
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt242244All0.000046
ORF1ab/nsp31389G1389VgGTgTG1244All0
ORF1ab/nsp31389G1389VgGTgTA1244All0
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---243243All0.000046
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt202203B.1.2410.163961
ORF1ab/nsp31389G1389SGgTAgC1203B.1.2410.000812
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt131131N.50.231449
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt129129B.1.1.70.000115
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt103103C.380.830645
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt9090B.1.617.20.000339
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---8080B.1.1.70.000072
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC7879AY.1180.004887
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA179AY.1180.000063
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt6666AY.40.000103
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt5051B.1.1.70.000045
ORF1ab/nsp31389G1389VgGTgTG151B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt4545AY.30.000448
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt3939B.1.20.000343
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt3838AY.250.000229
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt3434B.10.000311
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC2632B.1.1.70.000023
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG332B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA332B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt3131B.1.617.20.000117
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2727AY.430.00012
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt2525B.1.4290.000588
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2424B.1.10.000435
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG1422B.1.617.20.000053
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC822B.1.617.20.00003
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2020AY.30.000199
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt2020B.1.3510.000595
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1919AY.1030.000118
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1818AY.440.00011
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1717AY.1020.000451
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1717B.1.1770.000224
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1717B.1.617.20.000064
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt1516All0.000003
ORF1ab/nsp31389G1389DgGTgAC116All0
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---1616AY.40.000025
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1616B.10.000147
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1616B.1.20.000141
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt1515AY.1190.00053
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---1515B.1.1770.000198
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt1414AY.1000.000644
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1414AY.250.000084
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---1414B.10.000128
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1212AY.390.000297
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG711AY.430.000031
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC411AY.430.000018
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---1111B.1.20.000097
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1111B.1.360.001605
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt1111B.1.4290.000259
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt1111P.10.000173
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC1010AY.40.000016
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC1010P.10.000158
ORF1ab/nsp31389G1389del1ggTgg-38All0.000001
ORF1ab/nsp31389G1389del1Ggt-gt28All0
ORF1ab/nsp31389G1389del1gGTgA-18All0
ORF1ab/nsp31389G1389del1GgT-gN18All0
ORF1ab/nsp31389G1389del1GGT-NN18All0
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt88AY.290.000126
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---88B.1.10.000145
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt88B.1.4270.000404
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt88B.1.4990.008403
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.200.000272
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.410.002058
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt77AY.430.000031
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.460.000729
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.46.60.000505
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt67AY.590.003178
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt57AY.590.002648
ORF1ab/nsp31389G1389CGgTTgC27AY.590.001059
ORF1ab/nsp31389G1389SGgTAgC17AY.590.00053
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt77AY.99.20.000645
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66AY.1190.000212
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt56AY.440.00003
ORF1ab/nsp31389G1389CGgTTgC16AY.440.000006
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt66AY.470.000187
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66AY.540.000572
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC66AY.640.003571
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt66B.10.000055
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66B.1.1.5190.000238
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt66B.1.1770.000079
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt66R.10.00054
ORF1ab/nsp31389G1389AgGtgCt55All0.000001
ORF1ab/nsp31389G1389AgGtgCt55AY.1200.000186
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55AY.1200.000186
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt55AY.200.000194
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55AY.230.000349
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt55AY.260.000142
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt55AY.290.000079
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt55AY.40.000008
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---55AY.4.50.000537
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---55AY.430.000022
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt55AY.430.000022
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC55B.1.1770.000066
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55B.1.2580.000333
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---55B.1.617.20.000019
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt55P.10.000079
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---440.222222
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44AY.1030.000025
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.260.000113
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.420.000161
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.470.000124
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44AY.780.006163
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC24B.10.000018
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG14B.10.000009
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA14B.10.000009
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44B.1.1.1760.001757
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt34B.1.1.70.000003
ORF1ab/nsp31389G1389DgGTgAC14B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44B.1.177.810.000757
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---44B.1.2210.000284
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt44B.1.36.290.002069
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt44B.1.5260.000094
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt44C.350.003096
ORF1ab/nsp31389G1389RGgtCgt13All0
ORF1ab/nsp31389G1389RGgTAgA13All0
ORF1ab/nsp31389G1389RGgTAgG13All0
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt33AY.1030.000019
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33AY.1070.001398
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC33AY.1190.000106
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt33AY.260.000085
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt33AY.4.50.000322
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.50.000062
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.680.000821
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33AY.9.20.00011
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.960.006224
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33AY.98.10.000145
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33B.1.1600.000094
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---33B.1.2580.0002
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA23B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC13B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt33B.1.3890.003006
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33B.1.438.10.000322
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---33B.1.5250.000339
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---33B.1.5960.000261
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt220.111111
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---22A.2.40.006734
ORF1ab/nsp31389G1389YGGtTAt22All0
ORF1ab/nsp31389G1389NGGtAAt22All0
ORF1ab/nsp31389G1389del2gGTg--22All0
ORF1ab/nsp31389G1389IGGtATt22All0
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA12AY.1030.000006
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC12AY.1030.000006
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.1050.001286
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22AY.1130.000285
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.1160.000574
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC22AY.1200.000074
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.120.2.10.000997
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt22AY.130.000322
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt22AY.250.000012
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.3.10.000171
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt22AY.440.000012
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC12AY.440.000006
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA12AY.440.000006
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---22AY.46.20.001271
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.610.00021
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.630.000774
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22AY.9.10.000167
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.9.20.000073
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22AY.930.000546
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22B.1.1.10.000653
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.1.2610.017241
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.1.2790.002242
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.1.280.000622
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC22B.1.1.3060.000877
ORF1ab/nsp31389G1389RGgTAgG12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389RGgtCgt12B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA22B.1.20.000018
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22B.1.2210.000142
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt22B.1.2400.000431
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---22B.1.3110.000549
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22B.1.360.000292
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22B.1.4800.004975
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---22B.1.5170.000854
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt22B.1.6090.000959
ORF1ab/nsp31389G1389YGGtTAt22B.1.617.20.000008
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22C.10.004785
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt22C.370.000232
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---22P.10.000032
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt22P.20.000373
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11A0.000387
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11A0.000387
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11A.2.40.003367
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11A.23.10.000704
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11A.270.001656
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11A.280.002646
ORF1ab/nsp31389G1389KGGTAAA11All0
ORF1ab/nsp31389G1389MGGTATG11All0
ORF1ab/nsp31389G1389TGGTACA11All0
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AV.10.005051
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.1000.000046
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.1150.005208
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA11AY.1170.000085
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.1180.000063
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.120.000316
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.1200.000037
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.16.10.00047
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.240.000431
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.30.00001
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11AY.330.000067
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.340.000097
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.350.000233
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.360.000148
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.370.000316
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.390.000025
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.390.000025
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.4.20.000022
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.4.40.000409
ORF1ab/nsp31389G1389del1ggTgg-11AY.4.50.000107
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG11AY.420.00004
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.450.000122
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.460.000104
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.460.000104
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11AY.46.10.001027
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11AY.46.20.000635
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.46.40.000165
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11AY.470.000031
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.470.000031
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11AY.480.000465
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.50.000021
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.5.30.000337
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.510.000909
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11AY.530.000288
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.560.001605
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.60.000041
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.600.000938
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.650.000533
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.680.000274
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.730.000665
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.740.000116
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.75.10.00018
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11AY.9.20.000037
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11AY.910.00073
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11AY.99.20.000092
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B0.000128
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B0.000128
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.10.000009
ORF1ab/nsp31389G1389del2gGTg--11B.10.000009
ORF1ab/nsp31389G1389del1Ggt-gt11B.10.000009
ORF1ab/nsp31389G1389TGGTACA11B.10.000009
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.10.000018
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.1610.003534
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.1920.002309
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.2180.007692
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.2540.011236
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.1.2840.000107
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.2910.000742
ORF1ab/nsp31389G1389VgGTgTA11B.1.1.2940.001266
ORF1ab/nsp31389G1389RGgTAgA11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.3060.000438
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.3110.000358
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.3120.001912
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.3150.008475
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.330.000421
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.3480.000796
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.3720.000689
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11B.1.1.390.00051
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.4090.002833
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.4190.007407
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.460.004367
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA11B.1.1.470.005348
ORF1ab/nsp31389G1389del1ggTgg-11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389NGGtAAt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389IGGtATt11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389MGGTATG11B.1.1.70.000001
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1.700.000341
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1.710.006061
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1390.000733
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.1600.000031
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG11B.1.160.320.004292
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggG11B.1.160.70.002079
ORF1ab/nsp31389G1389del2gGTg--11B.1.1770.000013
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.150.000631
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.160.000664
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp31389G1389del1Ggt-gt11B.1.177.180.00116
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.210.000076
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.40.000211
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.430.001477
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.177.440.000519
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.540.000606
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.560.000668
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.60.000977
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.620.001192
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.680.015152
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.710.010101
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.750.001041
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.177.810.000189
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.870.000728
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.177.90.001332
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp31389G1389del1gGTgA-11B.1.20.000009
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.2100.002132
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.1.2210.000071
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.2370.004975
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.2580.000067
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.264.10.047619
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.3400.004292
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.3510.00003
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.351.30.000876
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.36.180.00042
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.36.220.001208
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.36.290.000517
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.1.36.80.001
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.4090.000781
ORF1ab/nsp31389G1389IGGtATt11B.1.4150.014286
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.416.10.001563
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.4270.00005
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.4290.000024
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.466.20.000391
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggA11B.1.5240.001406
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.5270.003704
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.5750.000303
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.5760.000907
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.1.5770.000687
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31389G1389KGGTAAA11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.617.10.000129
ORF1ab/nsp31389G1389del1ggTgg-11B.1.617.20.000004
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.619.10.000641
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.6210.000089
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11B.1.621.10.000506
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.6300.005236
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.340.013699
ORF1ab/nsp31389G1389NGGtAAt11B.4.40.018868
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11B.400.000364
ORF1ab/nsp31389G1389DgGtgAt11B.60.00091
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11B.60.00091
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11B.60.00091
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11C.120.007194
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11C.350.000774
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11C.360.000911
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11D.20.000075
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11D.20.000075
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11P.10.000016
ORF1ab/nsp31389G1389del1GgT-gN11P.10.000016
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11P.1.10.10.00813
ORF1ab/nsp31389G1389GggTggC11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp31389G1389VgGtgTt11P.1.140.000048
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11P.1.150.000232
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11P.20.000187
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11P.30.001595
ORF1ab/nsp31389G1389del1GGT-NN11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11Q.40.000455
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11Q.40.000455
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11Q.80.000165
ORF1ab/nsp31389G1389CGgtTgt11R.10.00009
ORF1ab/nsp31389G1389SGgtAgt11R.20.014493
ORF1ab/nsp31389G1389delGGT---11U.30.003861