CoV-GLUE | Mutations | Mutation

CoV-GLUE Mutation: ORF = ORF1ab/nsp3 : CodonNum = 1243 & Codon = Att

Details of the codons used for the mutation across all lineages (CodonProp is the proportion each codon is used for this AA mutation):

ORFCodonNumMutORF1abMutMutTypeRefCodonMutCodonAACountCodonCountCodonPropGenome Position
ORF1ab/nsp31243V1243IV2061InonsynGttAtt112811270.9991146446-6448

Details of the mutation no within lineages (LineageCodonProp is the proportion the codon is observed at, at this particular site, on each lineage):

ORFCodonNumMutRefCodonMutCodonCodonCountAACountLineageLineageCodonProp
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11271128All0.000216
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt326326AY.40.000507
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt248248B.1.1.70.000222
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt8787B.1.5750.026396
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt6262B.10.000568
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt2929B.1.617.20.000109
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt2323AY.1030.000143
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt2222B.1.20.000194
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt2020AY.4.40.008183
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1919AY.250.000114
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1818AY.390.000445
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1313AY.430.000058
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1212B.1.4200.125
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1111AY.270.000712
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1111AY.30.000109
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1111AY.470.000342
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt1010AY.4.20.000217
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt99B.1.4270.000454
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt88AY.1020.000212
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt88B.1.1770.000105
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt88P.10.000126
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt77AY.1060.002344
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt77AY.290.00011
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt66B.1.10.000109
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt55AY.260.000142
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt55AY.420.000201
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt55AY.50.000103
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44AY.1000.000184
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44AY.330.000267
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44AY.440.000024
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44AY.75.10.000721
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44AY.90.00027
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44B.1.5680.004444
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt44N.50.007067
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33AY.1080.003308
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33AY.1200.000112
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33AY.20.001068
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33AY.200.000117
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33AY.610.000314
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33AY.700.000626
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33B.1.2430.000209
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33B.1.4290.000071
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt33B.1.466.20.001174
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22A.23.10.001408
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.1140.000462
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.1180.000125
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.1190.000071
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.360.000296
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.4.50.000215
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.5.30.000675
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.670.000929
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22AY.810.003984
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22B.1.1.1590.009346
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22B.1.1600.000062
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22B.1.2240.05
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22B.1.2580.000133
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22B.1.3510.000059
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22B.1.6210.000177
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22P.1.150.000465
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22P.1.40.001953
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt22Q.80.00033
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.1090.00074
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.1160.000287
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.1210.000135
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.23.10.000417
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.29.10.000221
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.3.10.000085
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.300.000396
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.320.000532
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.39.10.00004
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.4.2.10.000149
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.400.000964
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.46.60.000072
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.5.40.000277
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.540.000095
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.590.00053
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.750.000056
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.980.000079
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11AY.98.10.000048
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B0.000128
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.1.2070.001182
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.1.270.00565
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.1.3690.000446
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.1.4350.034483
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.1280.000635
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.177.570.000281
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.177.70.000165
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.2130.014925
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.214.10.02
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.2340.000132
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.2400.000216
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.2640.012346
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.3020.013333
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.36.100.004785
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.36.170.000494
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.36.380.001642
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.5640.000426
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.5800.004065
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.5950.000261
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.5960.000087
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.6200.000946
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.6230.000536
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11B.1.6370.000073
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11P.20.000187
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11Q.10.000126
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11Q.30.000145
ORF1ab/nsp31243V1243IGttAtt11R.10.00009